ZFPM2-AS1 (ZFPM2 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ZFPM2-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
8q23.1
gene_family:
alias symbol:
SCAT3
alias name:
S-phase cancer-associated transcri…
entrez id:
102723356
ensembl gene id:
ENSG00000251003
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_125796
hgnc_id:
HGNC:50698
approved reserved:
2014-06-09

基因染色体位置

基因染色体位置

8q23.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ZFPM2-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA），位于人类染色体8q23.1区域，是ZFPM2基因的反义转录本。它通过调控ZFPM2基因的表达或其他机制参与多种生物学过程。ZFPM2-AS1在心脏发育中可能发挥重要作用，因为ZFPM2基因本身编码的锌指蛋白在心脏形态发生和功能维持中至关重要。该基因的突变或表达异常可能导致心脏发育缺陷，如法洛四联症等先天性心脏病。ZFPM2-AS1的过表达可能干扰ZFPM2的正常功能，影响心脏发育相关信号通路，而低表达可能导致ZFPM2表达失调，进而影响心脏或其他组织的正常发育。此外，ZFPM2-AS1在癌症中也有研究，其异常表达可能与肿瘤进展相关，例如在某些肺癌和胃癌中显示表达水平变化。ZFPM2属于锌指蛋白家族，该家族成员通常含有锌指结构域，能够与DNA、RNA或蛋白质相互作用，参与基因表达的调控。ZFPM2-AS1作为反义RNA，可能通过表观遗传修饰、转录干扰或mRNA稳定性调控等方式影响ZFPM2或其他基因的功能。虽然目前对ZFPM2-AS1的具体机制了解有限，但它在发育和疾病中的潜在作用使其成为研究关注点。未来研究可能揭示其在基因调控网络中的更多细节及其作为疾病标志物或治疗靶点的潜力。

None

无

OMIM数据库中对ZFPM2-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对ZFPM2-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

ZFPM2-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ZFPM2-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs894327       rs1372615       rs1442321       rs1899423       rs1968562       rs2028553       rs2241889       rs2241890       rs2958704       rs2958705       rs2958706       rs5893764       rs10097980       rs10098402       rs10103604       rs10103605       rs10104085      

基因表达

基因表达

ZFPM2-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCACTGCAACCTCTACCTC
60
GTGTAATTCCTGTAATCCCAGC
59
TCACTGCAACCTCTACCTC
59
ACCATGAGCTCTGTAATCCC
59
TCACTGCAACCTCTACCTC
58
ACCATGAGCTCTGTAATCCC
59
TCCTACAATGAATCCACCAG
57
TCTTTGAGCCACTCTTTGAG
58
CTCACTGCAACCTCTACCTC
60
TCTCCTCACCTGTAATCCCA
60
TTTGAACCTCAAAGAGTGGC
58
TGATGATCTAGACAAGGAGATCTC
59
TTGAACCTCAAAGAGACTAGCA
60
CTGTAAACTCTGTTGTCTCAGTG
59
TCTCATAGTGGAGCTTAAGATTCTC
60
TAGAGGTTGCAGTGAGTTGAG
60
CCTTCTGTCATGATTATTCTCACTG
60
CAGGAGGTAGAGGTTGCAG
60
TCCTACAATGAATCCACCAG
57
TCTTTGAGCCACTCTTTGAG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ZFPM2-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZFPM2-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ZFPM2-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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