XAGE1B (X antigen family member 1B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
XAGE1B
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.22
gene_family:
alias symbol:
CT12.1b|CT12.1c|CT12.1d
alias name:
cancer/testis antigen family 12, m…
entrez id:
653067
ensembl gene id:
ENSG00000204382
ucsc gene id:
uc064zig.1
refseq accession:
NM_001097604
hgnc_id:
HGNC:25400
approved reserved:
2006-06-30

基因染色体位置

基因染色体位置

Xp11.22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

XAGE1B属于XAGE基因家族，该家族是一组在X染色体上编码癌症/睾丸抗原（CTA）的基因，其成员通常在正常组织中表达受限，但在多种癌症和睾丸组织中高表达。XAGE1B作为一种CTA，主要参与免疫调节和肿瘤发生过程。它在多种癌症如肺癌、前列腺癌和黑色素瘤中过表达，可能与肿瘤的免疫逃逸和进展相关。XAGE1B的生物学功能尚未完全阐明，但研究表明它可能通过调节细胞增殖、凋亡和迁移参与肿瘤发生。XAGE1B的表达产物可能作为肿瘤相关抗原被免疫系统识别，从而成为癌症免疫治疗的潜在靶点。XAGE1B的突变或表达异常可能影响其功能，导致肿瘤发生或进展。XAGE1B过表达可能促进肿瘤细胞增殖、侵袭和转移，而降低表达可能抑制这些过程。XAGE1B与其他CTA家族成员共享一些共性，如组织特异性表达模式和潜在的免疫原性。XAGE1B与某些疾病的关系仍在研究中，但已有证据表明它可能与癌症的发生、发展和预后相关。XAGE1B的表达水平可能作为某些癌症的诊断或预后标志物。XAGE1B的生物学功能和临床意义仍需进一步研究以明确其在疾病中的作用机制和应用价值。

This gene is a member of the XAGE subfamily, which belongs to the GAGE family. The GAGE genes are expressed in a variety of tumors and in some fetal and reproductive tissues. This gene is strongly expressed in Ewing's sarcoma, alveolar rhabdomyosarcoma and normal testis. The protein encoded by this gene contains a nuclear localization signal and shares a sequence similarity with other GAGE/PAGE proteins. Because of the expression pattern and the sequence similarity, this protein also belongs to a family of CT (cancer-testis) antigens. Alternative splicing of this gene, in addition to alternative transcription start sites, results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2010]

该基因是XAGE亚科，属于GAGE家族的一员。的GAGE基因在多种肿瘤，并在一些胎儿和reproduct表示香港专业教育学院的组织。此基因在尤文肉瘤，肺泡横纹肌肉瘤和正常睾丸中强烈表达。由该基因编码的蛋白质包含核定位信号和共享与其他GAGE / PAGE的蛋白质的序列相似性。因为表达模式和序列相似性，这种蛋白也属于一个家族的CT（癌 - 睾丸）抗原。该基因的选择性剪接，除了替代转录起始位点，产生多个转录变体。 [由RefSeq的，2010年1月提供]

OMIM数据库中对XAGE1B基因的介绍     Wikipedia数据库中对XAGE1B基因的介绍

基因序列

基因序列

XAGE1B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

XAGE1B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs112090233      

基因表达

基因表达

XAGE1B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGTCAAGGTGAAGATAATACCT
57
CTTGTGGTTGCTCTTCACC
59
TGAGGTCTGGATTCTTTCTCC
59
GTGTGGTTCTGTGTTTGTG
57
GCGTCAAGGTGAAGATAATACC
59
TTGTGGTTGCTCTTCACCT
59
GAGGTCTGGATTCTTTCTCC
57
GTGTGGTTCTGTGTTTGTG
57
AGGTCTGGATTCTTTCTCCG
59
GTGTGGTTCTGTGTTTGTG
57
CGTCAAGGTGAAGATAATACCT
57
TTGTGGTTGCTCTTCACCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

XAGE1B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XAGE1B基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 XAGE1B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adenoid Cystic Carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm, Residual 0.00272435 1 0 LHGDN
Lung Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of testis 0.001900093 7 0 BeFree
Sarcoma 0.001085767 4 0 BeFree
melanoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000542884 2 0 BeFree
Alveolar rhabdomyosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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