VOPP1 (VOPP1 WW domain binding protein)

symbol:
VOPP1
locus group:
protein-coding gene
location:
7p11.2
gene_family:
alias symbol:
ECop|GASP|FLJ20532|DKFZp564K0822|WBP1L2
alias name:
Glioblastoma-amplified secreted pr…
entrez id:
81552
ensembl gene id:
ENSG00000154978
ucsc gene id:
uc003tqs.5
refseq accession:
NM_030796
hgnc_id:
HGNC:34518
approved reserved:
2009-07-30
7p11.2
基因染色体位置图

VOPP1(Vesicular Overexpressed in Cancer, Prosurvival Protein 1)是一种与细胞存活和癌症发展相关的基因,其编码的蛋白质主要定位于高尔基体和内质网等细胞器膜上。VOPP1的生物学功能尚未完全阐明,但研究表明它可能参与调控细胞增殖、凋亡抵抗和应激反应,尤其在肿瘤细胞中过表达时可能通过抑制凋亡信号通路(如内质网应激途径)来促进癌细胞存活。该基因在多种癌症(如乳腺癌、胃癌、肝癌)中异常高表达,可能与肿瘤的侵袭性和不良预后相关。若VOPP1表达降低,可能导致癌细胞对内质网应激诱导的凋亡更敏感,从而抑制肿瘤生长;而过表达则可能增强细胞对化疗药物的抵抗性。目前尚未明确报道VOPP1的致病性突变,但表观遗传修饰(如甲基化)可能影响其表达水平。VOPP1属于一个功能多样的膜相关蛋白家族,这类家族成员通常参与细胞内运输、膜动态平衡或信号转导,但VOPP1的具体家族归属尚未明确界定。其作用机制可能涉及与其他蛋白质(如Bcl-2家族成员)的相互作用,但具体通路仍需进一步研究。需要注意的是,现有数据多基于体外或动物模型,人类病理学中的确切角色仍需验证。

None

VOPP1基因的碱基序列:[NCBI]
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VOPP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs113847247       rs190883796       rs540177571       rs550198807       rs559746720       rs565210545       rs1404564       rs1880528       rs2030734       rs2222589       rs4439077       rs5884422       rs7790820       rs7794340       rs7807334       rs7807352       rs7807357      

VOPP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGAAGGACTCTATCCAACCT
59
AGAAGGAACCAGAAGTACCAC
60
CATCTTGCAGACTGCACAG
59
CCACAGCCTCTGTATGGAG
60
CGAAGGACTCTATCCAACCT
58
AGAAGGAACCAGAAGTACCAC
59
GGTACTTCTGGTTCCTTCTG
58
GTAGGACACATTGAAGGCT
57
GTTGAGAGTGCACAGAAGC
59
CCCATCATCAGAAGGAACCA
60
CCTAGGAAGAGGTGCACAG
60
TGTAGGACACATTGAAGGCT
59
CGAAGGACTCTATCCAACCT
59
AGAAGGAACCAGAAGTACCAC
60
CTTCTGTGCTCTTGCAGTG
59
TCAGAAGGAACCAGAAGTACC
59
GGTACTTCTGGTTCCTTCTG
58
GTAGGACACATTGAAGGCT
57
TTCCTTCTGATGATGGGCG
60
GAGTATATGGTCTGGGCCG
59
      尚未收录相关数据

VOPP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VOPP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C9JVH1 (UniProtKB)
IEA
GO:0030659
C9JVH1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004871
Q96AW1 (UniProtKB)
IMP
GO:0005768
Q96AW1 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q96AW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q96AW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
Q96AW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0030659
Q96AW1 (UniProtKB)
IDA
GO:0031301
Q96AW1 (UniProtKB)
IDA

可能调控 VOPP1基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.12 1 0 CTD_human
Squamous cell carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree

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