UCA1 (urothelial cancer associated 1)

symbol:
UCA1
locus group:
non-coding RNA
location:
19p13.12
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
LINC00178|CUDR|UCAT1|onco-lncRNA-36
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
652995
ensembl gene id:
ENSG00000214049
ucsc gene id:
uc002nbr.5
refseq accession:
NR_015379
hgnc_id:
HGNC:37126
approved reserved:
2009-07-15
19p13.12
基因染色体位置图

UCA1(Urothelial Cancer Associated 1)是一种长链非编码RNA(lncRNA),属于长链非编码RNA基因家族。该基因最初在膀胱尿路上皮癌中被发现,但后续研究表明它在多种癌症中异常表达。UCA1的主要生物学功能包括调控细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭,其作用机制涉及与多种microRNA(如miR-143、miR-195)结合形成竞争性内源RNA(ceRNA)网络,从而影响下游信号通路(如Wnt/β-catenin、PI3K/AKT)。UCA1还通过表观遗传调控(如DNA甲基化)影响基因表达。该基因的过表达与多种癌症(如膀胱癌、乳腺癌、胃癌、结直肠癌)的进展、转移和不良预后密切相关,而敲低UCA1可抑制肿瘤细胞的恶性行为。突变对UCA1功能的影响研究较少,但某些单核苷酸多态性(SNP)可能影响其表达或功能。UCA1属于lncRNA基因家族,该家族成员通常不编码蛋白质,但通过调控基因表达在多种生理和病理过程中发挥重要作用。UCA1的过表达可能通过激活EMT(上皮-间质转化)促进肿瘤转移,而降低表达则可能抑制肿瘤生长。此外,UCA1还参与化疗耐药性的形成,例如在膀胱癌中与顺铂耐药相关。该基因的表达受多种转录因子(如STAT3)调控,并可能作为癌症诊断和预后的潜在生物标志物。

None

UCA1基因的碱基序列:[NCBI]
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UCA1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs13896       rs14366       rs916957       rs1319147       rs1859300       rs4808389       rs7247124       rs7255437       rs7257698       rs7257792       rs7258210       rs7258861       rs7259139       rs7259448       rs11085994       rs11085995       rs11085996      

UCA1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTTCAAATCGGATCTCCTCG
58
ATCTGTGATGGTCCAAGGG
59
GACAACAGTACACGCATATGG
60
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59
GACAACAGTACACGCATATGG
60
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59
TTCAAATCGGATCTCCTCG
57
CATCTGTGATGGTCCAAGG
58
GACAACAGTACACGCATATGG
60
ATTGCAGATCTTTGTGTTGTCC
60
GACAACAGTACACGCATATGG
60
ATTGCAGATCTTTGTGTTGTCC
60
TTCAAATCGGATCTCCTCGG
60
ATCTGTGATGGTCCAAGGG
59
ACAACAGTACACGCATATGG
58
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59
ACAACAGTACACGCATATGG
58
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59
      尚未收录相关数据

UCA1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

UCA1基因的本体(GO)信息:

可能调控 UCA1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.003528744 13 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.003528744 13 0 BeFree
Bladder Neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Carcinoma, Transitional Cell 0.001900093 7 0 BeFree
Urothelial Carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree

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