TSSC4 (tumor suppressing subtransferable candidate 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TSSC4
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.5
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
10078
ensembl gene id:
ENSG00000184281
ucsc gene id:
uc001lwk.4
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NM_005706
hgnc_id:
HGNC:12386
approved reserved:
2000-04-13

基因染色体位置

基因染色体位置

11p15.5
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TSSC4（Tumor Suppressing Subtransferable Candidate 4）是一个肿瘤抑制基因，属于印迹基因家族（Imprinted gene family），这类基因的特点是仅来自父母一方的等位基因表达，而另一方的基因被沉默。TSSC4位于人类11号染色体的11p15.5区域，该区域与多种遗传疾病和癌症相关，如Beckwith-Wiedemann综合征（一种过度生长疾病）和某些儿童肿瘤。TSSC4的生物学功能尚未完全明确，但研究表明它可能参与细胞增殖、分化和凋亡的调控，其表达产物可能通过影响细胞周期或信号通路来抑制肿瘤发生。TSSC4的突变或表达异常可能导致其肿瘤抑制功能丧失，从而增加细胞异常增殖的风险，与某些癌症的发生发展相关。如果TSSC4过表达，可能会过度抑制细胞增殖，影响正常组织发育或功能；而降低表达则可能削弱其抑癌作用，促进肿瘤形成。TSSC4所在的印迹基因家族通常参与生长发育和代谢调控，其成员常表现出父母源特异性表达模式，并在胚胎发育和疾病中起关键作用。目前关于TSSC4的具体分子机制和相互作用网络仍需进一步研究。

This gene is one of several tumor-suppressing subtransferable fragments located in the imprinted gene domain of 11p15.5, an important tumor-suppressor gene region. Alterations in this region have been associated with the Beckwith-Wiedemann syndrome, Wilms tumor, rhabdomyosarcoma, adrenocortical carcinoma, and lung, ovarian, and breast cancer. This gene is located among several imprinted genes; however, this gene, as well as the pan-hematopoietic expression gene (PHEMX), escapes imprinting. This gene may play a role in malignancies and disease that involve this region. Several transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2014]

这个基因位于11p15.5的印记基因领域，一个重要的肿瘤抑制基因区几个肿瘤抑制subtransferable片段中的一个。在这一区域的改变已与贝克威思-威德曼综合征，肾母细胞瘤，横纹肌肉瘤，肾上腺皮质癌和肺癌，卵巢癌和乳腺癌有关。该基因位于中的几个印迹基因;然而，该基因，以及泛造血表达基因（PHEMX），逸出印迹。该基因可能参与涉及该区域恶性肿瘤和疾病的作用。一些转录变异体的编码两个不同的亚型已经发现了这种基因。 [由RefSeq的，2014年7月提供]

OMIM数据库中对TSSC4基因的介绍     Wikipedia数据库中对TSSC4基因的介绍

基因序列

基因序列

TSSC4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TSSC4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1057769       rs2234283       rs2234285       rs2234286       rs2522009       rs3198333       rs138874057       rs140185876       rs140715073       rs142312702       rs144386688       rs145703968       rs147234100       rs148810379       rs150751143       rs151277591       rs180892519      

基因表达

基因表达

TSSC4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCAGGAAGTTGAGCAGCT
59
CCTGATGAAGGTCCTCAGC
60
AAGATGTGACCGAGGTCTC
59
CTCTTGTTCCGGAAGTGGT
60
AAGATGTGACCGAGGAAGC
60
CCATCTCCCTCTCAGACCT
60
GTTGAGCAGCTGAACAGAG
59
CCTCTCAGATGGAATGGCT
59
GTTGAGCAGCTGAACAGAG
59
GAGTCACTGAGGGAGACTG
59
ACCATTAAATGAGTTGAGCAGC
60
CCTGATGAAGGTCCTCAGC
60
CATTAAATGAGTTGAGCAGCTG
58
CCCTGATGAAGGTCCTCAG
59
GTTGAGCAGCTGAACAGAG
59
CTCTCAGATGGAATGGCTG
58
AAGATGTGACCGAGGAAGC
60
ATCTCCCTCTCAGACCTCAG
60
CAGATTCCTTGGGAGCTCC
60
GTTCAGCTGCTCAACTTCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TSSC4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TSSC4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y5U2 (UniProtKB)
IPI

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TSSC4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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