TRRAP (transformation/transcription domain associated protein)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRRAP
locus group:
protein-coding gene
location:
7q22.1
gene_family:
alias symbol:
TR-AP|PAF400|Tra1
alias name:
None
entrez id:
8295
ensembl gene id:
ENSG00000196367
ucsc gene id:
uc011kis.2
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NM_003496
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HGNC:12347
approved reserved:
1998-10-06

基因染色体位置

基因染色体位置

7q22.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TRRAP（Transformation/transcription domain-associated protein）是一个在真核生物中高度保守的基因，编码的蛋白质属于PIKK（磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶）家族成员。该基因的产物并不具有激酶活性，但作为支架蛋白参与调控转录激活和DNA损伤修复。TRRAP是多个大型蛋白复合物的核心组分，包括组蛋白乙酰转移酶（HAT）复合物（如SAGA、STAGA和TIP60），这些复合物通过乙酰化组蛋白修饰染色质结构，从而调控基因表达。TRRAP的功能位点主要集中在细胞核内，通过与转录因子（如c-Myc、E2F）和DNA修复蛋白（如ATM、ATR）相互作用，参与细胞周期调控、增殖和基因组稳定性维持。若TRRAP发生功能丧失性突变，会导致DNA损伤应答缺陷、细胞周期停滞或凋亡异常，与多种癌症（如乳腺癌、结直肠癌）和神经发育障碍相关。过表达TRRAP可能通过异常激活原癌基因（如c-Myc）促进肿瘤发生，而表达降低则会导致转录失调和DNA修复障碍。TRRAP所属的PIKK家族共性包括：大分子量（>250kDa）、参与细胞应激响应（如DNA损伤、营养缺乏）以及与其他信号通路（如mTOR、ATM/ATR）交叉调控。该基因的翻译名称“转化/转录相关蛋白”已广泛使用，无需额外标注英文。

This gene encodes a large multidomain protein of the phosphoinositide 3-kinase-related kinases (PIKK) family. The encoded protein is a common component of many histone acetyltransferase (HAT) complexes and plays a role in transcription and DNA repair by recruiting HAT complexes to chromatin. Deregulation of this gene may play a role in several types of cancer including glioblastoma multiforme. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]

该基??因编码的磷酸肌醇3-激酶相关激酶（PIKK）家族的一个大的多结构域蛋白。所编码的蛋白质是多组蛋白乙酰转移酶（HAT）配合物的一个共同的组件，通过招募HAT络合物染色质起着转录和DNA修复中的作用。这个基因的失调可能在几种类型的癌症，包括胶质母细胞瘤中发挥作用。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2011年9月提供]

OMIM数据库中对TRRAP基因的介绍     Wikipedia数据库中对TRRAP基因的介绍

基因序列

基因序列

TRRAP基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRRAP基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs219815       rs219816       rs219817       rs1061496       rs11766509       rs12536022       rs55637395       rs55720437       rs58713239       rs71567512       rs73145605       rs73145606       rs75219906       rs75387850       rs76138554       rs76532215       rs77699268      

基因表达

基因表达

TRRAP基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACAGACTGTCGAAGTTTGGT
60
AATGAACTGAGCACCAGGT
59
TACCTTCAGTTTGTGGCAG
58
GGAGATGACGTGACATTCTC
58
CTACAAGAGCGATCCAGGG
60
CATCTGATCGACGATGCCT
60
ACAGACTGTCGAAGTTTGGT
60
AATGAACTGAGCACCAGGT
59
TTCATCATCGATTGTAACTGCC
59
CTGAAGCTGATGCATGAACC
60
GGGTAGAGGAAATGAAGATTTGC
60
ACAACCTCTAGCAAAGGCT
59
TCTTCAGATTAAGCCGAAGC
58
GAATCCAGTATCTCCTGCTG
58
TCTTCAGATTAAGCCGAAGC
58
GAATCCAGTATCTCCTGCTG
58
GGGTAGAGGAAATGAAGATTTGC
60
TCTAGCAAAGGCTTCACCA
59
CTTCAGTTTGTGGCAGCTC
60
AGGAGATGACGTGACATTCTC
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
TRRAP
CCND2
Activation
11511535
TRRAP
MITF
Repression
15581068

基因本体信息

TRRAP基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRRAP基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000123
C9K0N1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016573
C9K0N1 (UniProtKB)
IEA
GO:0000123
F2Z2U4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
F2Z2U4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
F2Z2U4 (UniProtKB)
IDA
GO:0016301
F2Z2U4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
F2Z2U4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016573
F2Z2U4 (UniProtKB)
IEA
GO:0000123
H0Y4W2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
H0Y4W2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
H0Y4W2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016573
H0Y4W2 (UniProtKB)
IEA
GO:0000125
Q9Y4A5 (UniProtKB)
NAS
GO:0000812
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0003712
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9Y4A5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9Y4A5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9Y4A5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005794
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006281
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IBA
GO:0006351
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IBA
GO:0016310
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016573
Q9Y4A5 (UniProtKB)
NAS
GO:0016578
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0030914
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0033276
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0035267
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0035267
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0043967
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0043968
Q9Y4A5 (UniProtKB)
IDA
GO:1904837
Q9Y4A5 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRRAP基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.120271442 1 1 BeFree_CTD_human
Schizophrenia 0.12 2 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Insulin Resistance 0.002367032 1 1 GAD
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Embryonal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
DOSAGE-SENSITIVE SEX REVERSAL 0.000271442 1 0 BeFree
Neurodegenerative Disorders 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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