TRIM25 (tripartite motif containing 25)

symbol:
TRIM25
locus group:
protein-coding gene
location:
17q22
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Ring finger proteins|Tripartite motif-containing
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EFP|RNF147
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HGNC:12932
approved reserved:
1994-03-16
17q22
基因染色体位置图

TRIM25(Tripartite Motif Containing 25)属于TRIM蛋白家族,这是一类具有E3泛素连接酶活性的蛋白质,其共同特点是含有三个保守的结构域:RING结构域(负责泛素化)、B-box结构域(参与蛋白质相互作用)和卷曲螺旋结构域(介导多聚化)。TRIM25在先天免疫反应中起关键作用,特别是在抗病毒防御中。它通过泛素化RIG-I(一种病毒RNA传感器)来激活I型干扰素反应,从而触发抗病毒免疫应答。TRIM25的表达产物具有调控细胞增殖、凋亡和炎症反应的功能,其作用位点包括细胞质和细胞核。突变或异常表达可能导致免疫功能紊乱,与自身免疫疾病(如系统性红斑狼疮)和某些癌症(如乳腺癌)相关。TRIM25过表达可能增强抗病毒反应但可能导致过度炎症,而表达降低则可能削弱免疫防御,增加病毒感染风险。TRIM家族成员通常参与细胞周期调控、转录调控和先天免疫,其功能多样性与不同的底物特异性有关。TRIM25还与RNA结合和应激颗粒形成有关,影响细胞应激反应。在癌症中,TRIM25可能作为癌基因或抑癌基因发挥作用,取决于癌症类型和细胞环境。

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to the cytoplasm. The presence of potential DNA-binding and dimerization-transactivation domains suggests that this protein may act as a transcription factor, similar to several other members of the TRIM family. Expression of the gene is upregulated in response to estrogen, and it is thought to mediate estrogen actions in breast cancer as a primary response gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的蛋白是三方母题(TRIM)家族中的一员。 TRIM的基序包括三个锌结合结构域,一个环,B框型1和B框2型,和一个卷曲螺旋区域。该蛋白质定位于细胞质。潜在DNA结合和二聚化,反式激活结构域的存在表明,该蛋白可能作为转录因子,类似于TRIM的家族的几个其它成员行动。该基因的表达被上调响应于雌激素,它被认为是介导的乳腺癌的雌激素的操作作为主反应基因。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

TRIM25基因的碱基序列:[NCBI]
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TRIM25基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs169529       rs61738274       rs66517862       rs76209640       rs111791086       rs113318936       rs113400839       rs114488274       rs137888736       rs139059030       rs139847998       rs141499024       rs141649169       rs142382736       rs144195803       rs144524626       rs145946401      

TRIM25基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTGTTCCCTCACGAAGTC
59
ACAGTTAGTTTGTGCCTCAG
58
TTGTCAGAGGAGACAGTAGC
59
TTTCTGTTTGCAGTCATCCG
59
TCTGGAAATCTCCAGGCTG
59
GATCTGAAGGCTACAGTAGCT
59
AGAAGGTCTCCAAAGAGGA
57
ATTTAGTTCTGTGCTCGGG
58
CGAGTTTCTGGAGAAAGCA
58
CTTGTGGTTCAGTTCCACC
59
CGAGTTTCTGGAGAAAGCA
57
CTTGTGGTTCAGTTCCACC
58
GTACAGTCAGATCAACGGG
58
TTCTGTTTGCAGTCATCCG
59
GTACAGTCAGATCAACGGG
58
TTCTGTTTGCAGTCATCCG
59
GCTCCTGGAGTATTACATTAAAGTC
60
AGCTACTGTATAGCACTCTGAC
59
GGATGAAGGGAAGTAGCCA
59
ATCATCCAGTGCTCTCGAC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
TRIM25
DDX58
Unknown

TRIM25基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRIM25基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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Q14258 (UniProtKB)
TAS
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
IMP
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Q14258 (UniProtKB)
IMP
GO:0042787
Q14258 (UniProtKB)
IMP
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
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Q14258 (UniProtKB)
IDA
GO:0045087
Q14258 (UniProtKB)
TAS
GO:0046596
Q14258 (UniProtKB)
IDA
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Q14258 (UniProtKB)
IEA
GO:0051091
Q14258 (UniProtKB)
IMP
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Q14258 (UniProtKB)
IMP
GO:0051607
Q14258 (UniProtKB)
IEA
GO:0060333
Q14258 (UniProtKB)
TAS
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Q14258 (UniProtKB)
IMP
GO:1902186
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IMP
GO:1902187
Q14258 (UniProtKB)
IEA
GO:1904264
Q14258 (UniProtKB)
IMP

可能调控 TRIM25基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Neoplasm Metastasis 0.00272435 1 0 LHGDN
Endometrial Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Adenocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Breast Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Influenza 0.000814326 3 0 BeFree
Dengue Fever 0.000271442 1 0 BeFree
Virus Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree

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