TRERF1 (transcriptional regulating factor 1)

symbol:
TRERF1
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.1
gene_family:
SANT/Myb domain containing
alias symbol:
TReP-132|HSA277276|RAPA|dJ139D8.5
alias name:
None
entrez id:
55809
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ENSG00000124496
ucsc gene id:
uc003osd.3
refseq accession:
NM_033502
hgnc_id:
HGNC:18273
approved reserved:
2003-11-26
6p21.1
基因染色体位置图

TRERF1(Transcriptional Regulating Factor 1)是一种转录调节因子,属于核受体辅调节因子家族。它主要通过结合核受体(如雌激素受体、雄激素受体等)来调控靶基因的转录活性,从而参与多种生物学过程,包括细胞增殖、分化、代谢平衡和生殖系统发育。TRERF1在多种组织中表达,尤其在睾丸、卵巢和肾上腺中表达较高,表明其在性激素信号通路和内分泌调节中具有重要作用。TRERF1的功能特点包括其能够作为辅激活因子或辅抑制因子,具体作用取决于细胞环境和结合的核受体类型。例如,在某些情况下,TRERF1可以增强雌激素受体的转录活性,而在其他情况下可能抑制雄激素受体的功能。TRERF1的突变可能导致其与核受体的结合能力改变,进而影响下游基因的表达调控。已有研究表明,TRERF1的异常表达或突变可能与某些激素依赖性癌症(如乳腺癌、前列腺癌)以及内分泌紊乱疾病相关。当TRERF1过表达时,可能增强某些核受体的转录活性,导致细胞增殖失控或激素信号通路异常激活,从而促进肿瘤发生。相反,TRERF1表达降低可能削弱核受体的正常功能,影响性激素的生理作用,甚至导致生殖或代谢异常。TRERF1属于核受体辅调节因子家族,该家族成员通常具有与核受体相互作用的结构域(如LXXLL模体),并通过招募其他转录机器组件(如组蛋白修饰酶或染色质重塑复合物)来调节基因表达。家族成员的共性是能够灵活地调节核受体的转录活性,从而广泛参与发育、代谢和疾病过程。TRERF1的功能多样性使其成为研究激素相关疾病和癌症治疗潜在靶点的重要分子。

This gene encodes a zinc-finger transcriptional regulating protein which interacts with CBP/p300 to regulate the human gene CYP11A1. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2014]

该基因编码与CBP / p300的相互作用调节人类基因CYP11A1锌指转录调控蛋白。在多个转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的,2014年7月提供]

TRERF1基因的碱基序列:[NCBI]
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TRERF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4714585       rs6935563       rs7739515       rs7739621       rs7741990       rs7742167       rs7742263       rs7742295       rs7742321       rs7742481       rs7742960       rs7762738       rs9296381       rs9367137       rs9462784       rs9462785       rs9462786      

TRERF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGGAGTGTGGCAAAGTC
59
TCTGTTGTTCCTCCTGCTG
59
TTACCACTATGCCGGTTCG
59
AGTCTTTGCTGTAAGTGGCT
59
CTGTAGATGTTGAACCACGC
59
CCAGGGCAGAGATATCTTGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
TRERF1
CCR7
Unknown
TRERF1
CD40
Repression
TRERF1
CD80
Repression
TRERF1
CD86
Repression
TRERF1
LILRB1
Repression
TRERF1
LILRB2
Repression
TRERF1
LILRB4
Repression

TRERF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRERF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000118
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0001104
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0003700
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005667
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0006351
Q96PN7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0006694
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0006707
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0007275
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0008134
Q96PN7 (UniProtKB)
IPI
GO:0008301
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0030374
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0042592
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0044212
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0045893
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q96PN7 (UniProtKB)
IEA
GO:0046885
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS

可能调控 TRERF1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.123267234 3 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Peripheral Neuropathy 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Limb ischemia 0.000271442 1 0 BeFree
Noninfiltrating Intraductal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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