TMEFF1 (transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 1)

symbol:
TMEFF1
locus group:
protein-coding gene
location:
9q31.1
gene_family:
alias symbol:
H7365|CT120.1
alias name:
tomoregulin-1|cancer/testis antige…
entrez id:
8577
ensembl gene id:
ENSG00000241697
ucsc gene id:
uc004baz.3
refseq accession:
NM_003692
hgnc_id:
HGNC:11866
approved reserved:
1998-08-06
9q31.1
基因染色体位置图

TMEFF1(全称为Transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1,中文可译为“具有表皮生长因子样和两个卵泡抑素样结构域的跨膜蛋白1”)是一种编码跨膜蛋白的基因,属于TMEFF基因家族(包括TMEFF1和TMEFF2)。该家族蛋白的共同特点是含有表皮生长因子(EGF)样结构域和卵泡抑素(follistatin)样结构域,这些结构域通常参与细胞间信号传导和蛋白质相互作用。TMEFF1主要在神经系统(如大脑皮层、海马体)和前列腺中高表达,其蛋白产物可能通过调控细胞增殖、分化或凋亡发挥作用,但具体机制尚未完全明确。研究表明,TMEFF1可能通过Wnt或BMP等信号通路影响神经发育和肿瘤发生。若该基因发生突变,可能导致其蛋白功能异常,例如丧失抑制肿瘤的能力,与胶质母细胞瘤、前列腺癌等疾病相关。当TMEFF1过表达时,可能抑制某些癌细胞的生长(如在前列腺癌中表现出肿瘤抑制作用),但矛盾的是,在其他背景下可能促进肿瘤进展,这种双重角色可能与组织特异性有关。反之,若TMEFF1表达降低,可能解除对癌细胞增殖的抑制,导致疾病恶化。此外,TMEFF1的表达变化可能影响其他基因(如Wnt通路相关基因)的活性,进而干扰细胞命运决定。目前关于TMEFF1的研究仍在深入,其精确功能及调控网络需进一步探索。

None

TMEFF1基因的碱基序列:[NCBI]
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TMEFF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1226590       rs1226591       rs1226592       rs2780959       rs2780960       rs2800282       rs2800283       rs2800284       rs2800285       rs7859754       rs13295029       rs16919204       rs16919211       rs41274967       rs41274969       rs73495724       rs73657327      

TMEFF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGGAGAAGGAGAAGAGGA
57
CAGCTTTATATTTGCAGGGTC
57
GGATCTGGAGAAGGAGAAGAG
59
TTTATATTTGCAGGGTCCACAC
59
ATCTGGAGAAGGAGAAGAGG
58
GCTTTATATTTGCAGGGTCCA
59
      尚未收录相关数据

TMEFF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TMEFF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q8IYR6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q8IYR6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q8IYR6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TMEFF1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Brain Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Cleft Palate 0.002367032 1 0 GAD
Cleft Lip 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of brain 0.000271442 1 0 BeFree

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