SYCP1 (synaptonemal complex protein 1)

symbol:
SYCP1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p13.2
gene_family:
alias symbol:
HOM-TES-14|SCP1|CT8
alias name:
cancer/testis antigen 8
entrez id:
6847
ensembl gene id:
ENSG00000198765
ucsc gene id:
uc001efr.5
refseq accession:
NM_003176
hgnc_id:
HGNC:11487
approved reserved:
1997-01-14
1p13.2
基因染色体位置图

SYCP1(Synaptonemal Complex Protein 1)是减数分裂过程中形成联会复合体(synaptonemal complex, SC)的核心支架蛋白,属于联会复合体蛋白家族。该家族成员(如SYCP2、SYCP3)的共同特点是参与同源染色体配对、重组和交换,确保减数分裂的正常进行。SYCP1通过其卷曲螺旋结构域与SYCP3结合,形成横向纤维(lateral elements),进而连接同源染色体的轴心结构,维持联会复合体的稳定性。其表达产物在生殖细胞中特异性高表达,尤其在精母细胞和卵母细胞的减数分裂前期发挥关键作用。若SYCP1发生功能丧失性突变(如截短突变或错义突变),会导致联会复合体组装异常,同源染色体无法正确配对,引发减数分裂阻滞、非整倍体配子生成,最终造成男性无精症(azoospermia)或女性卵巢早衰(POF)等生育障碍。研究发现SYCP1突变与特发性非梗阻性无精症(NOA)显著相关。过表达SYCP1可能干扰联会复合体的动态解聚,影响减数分裂进程;而表达降低则直接破坏染色体联会,增加异常染色体分离风险。此外,SYCP1通过调控DNA双链断裂修复和交叉互换(crossover)的形成,间接影响遗传多样性。在癌症中,SYCP1的异常表达可能与基因组不稳定性相关,但具体机制尚待深入研究。该基因的生物学功能高度保守,从酵母到人类均存在同源基因(如Zip1 in yeast),凸显其在有性生殖中的核心地位。

None

SYCP1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
SYCP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs360650       rs360651       rs360652       rs360653       rs474584       rs591544       rs1286571       rs7522275       rs7522281       rs11102850       rs12057904       rs12084097       rs12139020       rs72694094       rs72694095       rs75717821       rs77174529      

SYCP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGAC
59
AGTTCAATCTCCAAAGATGCTC
59
GTACAGAAGCTGAACTGAGAC
59
CATTTCCAAATTGCAGTTCCTG
59
TTGGTCTTCTCCAAGCCAG
60
TGTGGTAATGGCAGTTAACTG
59
CATTGCCAAAGAGCATGGT
59
CAAAGATGAGAAGCTGGTGG
59
AGAAATCACAGACACCTATCAG
58
TTGCTTTCTCAACCTCTTCC
58
AGAAATCACAGACACCTATCAG
58
TTGCTTTCTCAACCTCTTCC
58
CAAAGAAATTGCCTGCTATGTC
59
GTGGCACATATACACCATGG
59
AAGAGAATAATGCCACAAGGC
59
CATAGCAGGCAATTTCTTTGTC
59
GAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGAC
59
AGTTCAATCTCCAAAGATGCTC
59
GAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGAC
59
AGTTCAATCTCCAAAGATGCTC
59
      尚未收录相关数据

SYCP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SYCP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000795
A0A087WZC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007130
A0A087WZC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000711
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000775
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000795
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0000801
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000802
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0001673
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0007129
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007130
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007130
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007131
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007283
Q15431 (UniProtKB)
TAS
GO:0032880
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0035092
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0051026
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0051301
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0051878
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000795
Q5VXJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007130
Q5VXJ5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SYCP1基因的相关microRNA:     

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pancreatic Neoplasm 0.12 1 0 CTD_human
Adenocarcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Azoospermia 0.002367032 1 0 GAD
Oligospermia 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of testis 0.001085767 4 0 BeFree
Lymphoma, T-Cell, Cutaneous 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Myeloid Leukemia, Chronic 0.000271442 1 0 BeFree
Xeroderma Pigmentosum 0.000271442 1 0 BeFree
Myeloid Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。