ST20 (suppressor of tumorigenicity 20)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ST20
locus group:
non-coding RNA
location:
15q25.1
gene_family:
alias symbol:
HCCS-1
alias name:
human cervical cancer suppressor 1
entrez id:
400410
ensembl gene id:
ENSG00000180953
ucsc gene id:
uc059mie.1
refseq accession:
NR_037652
hgnc_id:
HGNC:33520
approved reserved:
2007-07-16

基因染色体位置

基因染色体位置

15q25.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ST20（也称为 ST20-AS1 或 ST20-AS1基因）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，其功能尚未完全明确，但研究表明它可能在细胞增殖、分化及肿瘤发生发展中起调控作用。ST20的表达产物不编码蛋白质，而是通过调控其他基因的表达或参与信号通路来发挥作用。该基因的主要作用位点可能涉及细胞周期调控和表观遗传修饰，尤其在癌症中可能影响肿瘤细胞的生长和转移。ST20的突变或异常表达可能破坏其调控功能，导致细胞增殖失控，与多种癌症（如肝癌、乳腺癌和结直肠癌）的发生发展相关。ST20过表达可能促进肿瘤细胞的侵袭和转移，而降低表达则可能抑制肿瘤进展，但其具体机制仍需进一步研究。ST20属于长链非编码RNA基因家族，这类基因通常不编码蛋白质，但通过调控mRNA稳定性、转录因子活性或染色质重塑等方式影响基因表达。该家族的共性包括参与多种生物学过程（如发育、免疫反应和疾病发生）并具有组织特异性表达模式。ST20的研究仍处于早期阶段，未来可能揭示其在疾病诊断或治疗中的潜在价值。

None

无

OMIM数据库中对ST20基因的介绍     Wikipedia数据库中对ST20基因的介绍

基因序列

基因序列

ST20基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ST20基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs7257       rs2115538       rs2115539       rs2562759       rs2586167       rs2920398       rs2920399       rs2920400       rs12440609       rs73474598       rs75069690       rs76957526       rs115300371       rs139874813       rs145958108       rs184575290       rs191787431      

基因表达

基因表达

ST20基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
ATCCAGCCAGATTTAGGCT
59
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
ATCCAGCCAGATTTAGGCT
59
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
ATCCAGCCAGATTTAGGCT
59
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
ATCCAGCCAGATTTAGGCTC
60
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
ATCCAGCCAGATTTAGGCTC
60
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
ATCCAGCCAGATTTAGGCTC
60
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
TCCAGCCAGATTTAGGCTC
59
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
TCCAGCCAGATTTAGGCTC
59
CTCTGTCTCCCAGGTTCAG
59
TCCAGCCAGATTTAGGCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ST20基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ST20基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001836
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0005741
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0008053
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0008630
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0015267
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0042803
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0043065
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0046982
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0055085
Q9HBF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0097192
Q9HBF5 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ST20基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Liver neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Liver and Intrahepatic Biliary Tract Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Metastatic Carcinoma to the Uterine Cervix 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of cervix 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of liver 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Cervix carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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