SSX9P (SSX family member 9, pseudogene)

symbol:
SSX9P
locus group:
pseudogene
location:
Xp11.23
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
280660
ensembl gene id:
ENSG00000204648
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_073393
hgnc_id:
HGNC:19655
approved reserved:
2002-11-19
Xp11.23
基因染色体位置图

SSX9P是一个假基因,属于SSX基因家族。假基因通常是由功能基因复制而来但失去了编码蛋白质能力的DNA序列。SSX基因家族共有10个成员(SSX1-SSX9和SSX9P),主要位于X染色体上。这个家族的共性是其成员都含有高度保守的SSX结构域,且多数成员在正常睾丸组织中表达,但在其他组织中表达受限。SSX家族基因通常与癌症相关,特别是滑膜肉瘤,其中SSX1、SSX2和SSX4经常与SYT基因发生融合形成致癌的SYT-SSX融合蛋白。作为假基因,SSX9P不编码功能性蛋白,因此其突变或表达水平变化对机体影响较小。由于假基因可能通过转录本或调控机制影响其同源功能基因的表达,SSX9P的过表达理论上可能干扰SSX家族其他功能基因的正常表达调控,但目前尚无明确证据。SSX9P的研究较少,但SSX家族在癌症免疫治疗中受到关注,因为其编码的蛋白可能成为肿瘤特异性抗原。需要注意的是,假基因虽然不编码蛋白,但可能通过产生非编码RNA或作为竞争性内源RNA(ceRNA)参与基因调控网络。

The product of this gene belongs to the family of highly homologous synovial sarcoma X (SSX) breakpoint proteins. These proteins may function as transcriptional repressors. They are also capable of eliciting spontaneously humoral and cellular immune responses in cancer patients, and are potentially useful targets in cancer vaccine-based immunotherapy. SSX1, SSX2 and SSX4 genes have been involved in the t(X;18) translocation characteristically found in all synovial sarcomas. This gene appears not to be involved in this type of chromosome translocation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因的产物属于家庭高度同源的滑膜肉瘤X(SSX)断点蛋白质。这些蛋白质可以充当转录抑制。它们也能够引发癌症患者自发的体液和细胞免疫应答,且是潜在的癌症基于疫苗免疫治疗的目标。 SSX1,SSX2和SSX4基因参与了T(X; 18)易位在所有的滑膜肉瘤特征性发现。该基因似乎没有参与这种类型的染色体易位。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SSX9P基因的碱基序列:[NCBI]
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SSX9P基因的碱基突变:           仅显示部分snp

SSX9P基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

SSX9P基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SSX9P基因的本体(GO)信息:

可能调控 SSX9P基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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