SRA1 (steroid receptor RNA activator 1)

symbol:
SRA1
locus group:
protein-coding gene
location:
5q31.3
gene_family:
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SRA|STRAA1
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None
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10011
ensembl gene id:
ENSG00000213523
ucsc gene id:
uc003lga.4
refseq accession:
NM_001035235
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HGNC:11281
approved reserved:
2000-04-13
5q31.3
基因染色体位置图

SRA1(Steroid Receptor RNA Activator 1)是一种长链非编码RNA(lncRNA),属于SRA基因家族。该家族成员具有调控基因表达的功能,主要通过RNA分子本身而非编码蛋白质发挥作用。SRA1的主要生物学功能是作为核受体(如雌激素受体、孕激素受体等)的共激活因子,通过结合这些受体增强其转录活性,从而参与激素信号通路的调控。其作用位点主要在细胞核内,通过与核受体及转录复合物相互作用影响靶基因表达。SRA1的突变可能导致其与核受体的结合能力改变,进而影响激素依赖性基因的表达调控,与乳腺癌、卵巢癌等激素相关肿瘤的发生发展相关。若SRA1过表达,可能过度激活核受体信号通路,促进细胞增殖或抑制凋亡;而表达降低则可能导致激素信号响应减弱,影响正常生理功能。SRA基因家族的共性包括:均以RNA形式发挥作用,参与表观遗传调控(如染色质修饰),且多与核受体信号通路交叉。目前研究发现,SRA1还能通过竞争性结合miRNA或形成RNA-蛋白质复合物影响其他基因的表达网络,例如与肿瘤转移相关的基因。在疾病方面,SRA1的表达异常已被报道与多种癌症(如子宫内膜癌、前列腺癌)的进展和耐药性相关,其机制涉及对激素治疗敏感性的调控。需要注意的是,"Steroid Receptor RNA Activator"的中文译名存在差异,部分文献也称之为"类固醇受体RNA激活剂"。

Both long non-coding and protein-coding RNAs are transcribed from this gene, and they represent alternatively spliced transcript variants. This gene was initially defined as a non-coding RNA, which is a coactivator for several nuclear receptors (NRs) and is associated with breast cancer. It has now been found that this gene is involved in the regulation of many NR and non-NR activities, including metabolism, adipogenesis and chromatin organization. The long non-coding RNA transcripts interact with a variety of proteins, including the protein encoded by this gene. The encoded protein acts as a transcriptional repressor by binding to the non-coding RNA. [provided by RefSeq, Mar 2012]

两个长的非编码和编码蛋白质的RNA的从该基因转录,它们代表可变剪接转录物变体。该基因最初定义为一个非编码的RNA,这是几个核受体(NRS)共活化剂,并与乳腺癌有关。现已发现,这种基因是参与许多NR和非NR活动,包括代谢,脂肪形成和染色质组织的调节。长非编码RNA转录与多种蛋白质,包括由该基因编码的蛋白质相互作用。所编码的蛋白质作为通过结合非编码的RNA转录阻遏。 [由RefSeq的,2012年3月提供]

SRA1基因的碱基序列:[NCBI]
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SRA1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs71581542       rs73791726       rs138197720       rs141232542       rs182297351       rs542206386       rs562094322       rs563066264       rs574255744       rs110346       rs110347       rs387382       rs415797       rs434851       rs3172959       rs11955267       rs17855437      

SRA1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAGAATGGCTCTACTGGTG
59
ACTTAGTTCCTCAGTCACATGG
60
CTCTACTGGTGCAAGAGCT
59
CTCAGTCACATGGTCAACC
58
GAGTCTGAGGCTGTGATGG
60
CACATACCTGCTTCCTTGTG
59
CTCTACTGGTGCAAGAGCT
59
CTCAGTCACATGGTCAACC
58
GAGTCTGAGGCTGTGATGG
60
CACATACCTGCTTCCTTGTG
59
GAGTCTGAGGCTGTGATGG
60
CACATACCTGCTTCCTTGTG
59
CTAACAGTGGAGTTCCGGG
60
ATCACATACCTGCTTCTCTGG
60
GTCTGAGGCTGTGATGGAG
60
CACATACCTGCTTCCTTGTG
59
GTCTGAGGCTGTGATGGAG
60
CACATACCTGCTTCCTTGTG
59
AGAATGGCTCTACTGGTGC
60
ACTTAGTTCCTCAGTCACATGG
60
      尚未收录相关数据

SRA1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SRA1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003713
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q9HD15 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HD15 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q9HD15 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q9HD15 (UniProtKB)
IEA
GO:0006915
Q9HD15 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0016922
Q9HD15 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0030374
Q9HD15 (UniProtKB)
IBA
GO:0030529
Q9HD15 (UniProtKB)
IPI
GO:0042981
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:0045171
Q9HD15 (UniProtKB)
IDA
GO:2000273
Q9HD15 (UniProtKB)
IBA

可能调控 SRA1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.009258818 6 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.00643866 16 0 BeFree_GAD
Breast Carcinoma 0.004071628 15 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Sudden infant death syndrome 0.00272435 1 0 LHGDN
Cystadenocarcinoma, Serous 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of lung 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Chronic Obstructive Airway Disease 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Narcolepsy 0.002367032 1 0 GAD
Epithelial ovarian cancer 0.002367032 1 0 GAD

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