SPHK2 (sphingosine kinase 2)

基因基本信息

基因基本信息

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SPHK2
locus group:
protein-coding gene
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19q13.33
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None
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56848
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uc002pjr.4
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HGNC:18859
approved reserved:
2002-07-05

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SPHK2（鞘氨醇激酶2）属于鞘氨醇激酶基因家族，该家族还包括SPHK1，两者共同负责催化鞘氨醇磷酸化生成鞘氨醇-1-磷酸（S1P），这是一种重要的生物活性脂质信号分子。SPHK2主要在细胞核和线粒体中表达，与SPHK1的胞质定位不同，这种亚细胞定位差异暗示它们可能具有不同的功能。S1P作为细胞内外信号分子，参与调控细胞增殖、存活、迁移和炎症反应等多种生物学过程。SPHK2在多种组织中表达，尤其在脑、心脏和肝脏中表达较高。研究表明，SPHK2在调节细胞凋亡、自噬和能量代谢中发挥重要作用。SPHK2的突变或表达异常可能导致其功能受损，进而影响S1P的生成和信号传导，与多种疾病相关，包括癌症、神经退行性疾病、心血管疾病和代谢紊乱。在癌症中，SPHK2的表达水平可能因肿瘤类型而异，在某些情况下高表达促进肿瘤生长和转移，而在其他情况下则可能抑制肿瘤进展。SPHK2的过表达可能导致S1P水平升高，进而激活下游信号通路如PI3K/AKT和MAPK，促进细胞存活和增殖，但也可能诱导细胞凋亡，这取决于细胞类型和微环境。相反，SPHK2表达降低可能导致S1P水平下降，影响细胞迁移和血管生成，并可能增强某些化疗药物的敏感性。SPHK2还与炎症反应密切相关，其表达变化可能影响免疫细胞的功能和炎症因子的释放。此外，SPHK2在神经系统中的作用日益受到关注，它可能通过调节S1P水平影响神经元存活和突触可塑性，与阿尔茨海默病等神经退行性疾病有关。SPHK2抑制剂正在被研究作为潜在的治疗药物，特别是在癌症和炎症性疾病中。总的来说，SPHK2作为鞘氨醇激酶家族的重要成员，通过调控S1P代谢参与多种生理和病理过程，其功能的精细调控对维持机体稳态至关重要。

This gene encodes one of two sphingosine kinase isozymes that catalyze the phosphorylation of sphingosine into sphingosine 1-phosphate. Sphingosine 1-phosphate mediates many cellular processes including migration, proliferation and apoptosis, and also plays a role in several types of cancer by promoting angiogenesis and tumorigenesis. The encoded protein may play a role in breast cancer proliferation and chemoresistance. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

这个基因编码催化的鞘氨醇磷酸化成鞘氨醇1-磷酸鞘氨醇2激酶同工酶之一。鞘氨醇-1-磷酸介导许多细胞过程，包括迁移，增殖和凋亡，也起着几种类型的癌症通过促进血管发生和肿瘤发生的作用。所编码的蛋白质可能在乳腺癌细胞增殖和化疗的作用。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2011年8月提供]

OMIM数据库中对SPHK2基因的介绍     Wikipedia数据库中对SPHK2基因的介绍

基因序列

基因序列

SPHK2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPHK2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2301139       rs6413475       rs6413476       rs80273410       rs113160409       rs113533854       rs117309075       rs143249693       rs144333545       rs148306408       rs148363247       rs187175211       rs369164659       rs371192457       rs528577366       rs532719113       rs536595061      

基因表达

基因表达

SPHK2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
ATCTACACCTACCCTCGGG
60
ACGGTTCTCTTCGTAGGTG
59
ACCTCATCCAGACAGAACG
59
GATCTAGGAGCCCGTTCAG
59
CAGCAGGACCAGAGATCAC
60
GACCAATAGAAGCAACCGG
59
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58
AGAATTTCCTCCATAGGCAG
57
AGAGATACATCACCCAGACAC
59
GCAGTGGTGTAAGAACCAC
59
TTCTGTCGTTCTGTCTGGA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPHK2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPHK2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016301
A0A075B7A1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
A0A075B7A1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
E9PCV4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
E9PCV4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
M0R0E9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
M0R0E9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
M0R344 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
M0R344 (UniProtKB)
IEA
GO:0001568
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003376
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NRA0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005765
Q9NRA0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9NRA0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0006669
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0007420
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007565
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0008284
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008481
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0008481
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
Q9NRA0 (UniProtKB)
IDA
GO:0017016
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0017050
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0030148
Q9NRA0 (UniProtKB)
TAS
GO:0038036
Q9NRA0 (UniProtKB)
IMP
GO:0043066
Q9NRA0 (UniProtKB)
NAS
GO:0046512
Q9NRA0 (UniProtKB)
IGI
GO:0046512
Q9NRA0 (UniProtKB)
IMP
GO:0046834
Q9NRA0 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPHK2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Infarction, Middle Cerebral Artery 0.12 1 0 CTD_human
Breast Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Glioblastoma 0.000814326 3 0 BeFree
Glioma 0.000542884 2 0 BeFree
Acute lymphocytic leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Astrocytoma 0.000271442 1 0 BeFree
Pulmonary Fibrosis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Multiple Myeloma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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