SPANXN4 (SPANX family member N4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPANXN4
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq27.3
gene_family:
alias symbol:
SPANX-N4|CT11.9
alias name:
cancer/testis antigen family 11, m…
entrez id:
441525
ensembl gene id:
ENSG00000189326
ucsc gene id:
uc004fbv.4
refseq accession:
NM_001009613
hgnc_id:
HGNC:33177
approved reserved:
2006-11-13

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq27.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SPANXN4（Sperm Protein Associated with the Nucleus on the X chromosome, family member N4）属于SPANX基因家族，该家族主要编码与精子发生和男性生殖功能相关的核蛋白。SPANX基因家族的共性在于其成员通常在睾丸中高表达，并且它们的蛋白质产物倾向于定位在细胞核内，特别是在精子发生过程中发挥作用。SPANXN4的具体生物学功能尚未完全阐明，但研究表明它可能在精子成熟、染色质浓缩或精子运动性中起关键作用。SPANXN4的表达产物是一种核蛋白，可能在精子细胞分化阶段参与染色质重塑或基因表达调控。该基因的主要作用位点是精子细胞的细胞核，尤其是在精子发生的后期阶段。SPANXN4的突变可能影响精子的正常发育或功能，导致男性不育或精子质量下降。目前尚未发现SPANXN4与特定疾病的直接关联，但由于其在生殖系统中的重要作用，其异常表达可能与男性生殖障碍有关。如果SPANXN4过表达，可能会干扰精子发生的正常进程，导致精子形态或功能异常；而降低表达则可能影响精子的成熟或运动能力，进而降低生育能力。SPANXN4的表达水平变化还可能影响其他与精子发生相关的基因，例如那些参与染色质包装或能量代谢的基因，从而对整个生殖系统产生连锁反应。SPANX基因家族的其他成员（如SPANXA、SPANXB等）也在男性生殖系统中发挥类似作用，但每个成员可能具有特定的时空表达模式或功能差异。由于SPANXN4的研究相对较少，未来需要更多实验来揭示其精确机制以及与人类健康或疾病的具体联系。

This gene represents one of several duplicated family members that are located on the X chromosome. This gene family encodes proteins that play a role in spermiogenesis. These proteins represent a specific subgroup of cancer/testis-associated antigens, and they may be candidates for tumor vaccines. This family member belongs to a subgroup of related genes that are present in all primates and rats and mice, and thus, it represents one of the ancestral family members. [provided by RefSeq, Sep 2009]

这个基因代表，它们位于X染色体上的几个重复家族成员之一。该基因家族编码，在精子形成中发挥作用的蛋白质。这些蛋白质代表癌症/睾丸相关抗原的特定子群，并且它们可以是对于肿瘤疫苗的候选者。氏家族成员所属的存在于所有灵长类和大鼠和小鼠相关基因的亚组，并且因此，它代表祖家族成员之一。 [由RefSeq的，2009年09月提供]

OMIM数据库中对SPANXN4基因的介绍     Wikipedia数据库中对SPANXN4基因的介绍

基因序列

基因序列

SPANXN4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPANXN4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs781715498       rs781659042       rs781621907       rs781499272       rs781410886       rs781212260       rs781029116       rs780976328       rs780599201       rs780580943       rs780491515       rs780264921       rs780369330       rs780260740       rs779534101       rs779522534       rs779453405      

基因表达

基因表达

SPANXN4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGAAGAGCCAACTTCCAG
60
TCTCTTTCAAACTCTGTTCAGG
58
TGGAGAATAACCAGCCTACAG
59
CTTCCTCTCCATCCTGTGG
59
TGGAAGAGCCAACTTCCAG
60
CTCTTTCAAACTCTGTTCAGGG
59
GGAGAATAACCAGCCTACAG
58
TCTTCCTCTCCATCCTGTG
58
TGGAAGAGCCAACTTCCAG
60
TCTTTCAAACTCTGTTCAGGG
58
GAGAATAACCAGCCTACAGAG
58
TCTTCCTCTCCATCCTGTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPANXN4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPANXN4基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPANXN4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Blood pressure finding 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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