SLCO6A1 (solute carrier organic anion transporter family member 6A1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLCO6A1
locus group:
protein-coding gene
location:
5q21.1
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
OATP6A1|OATPY|MGC26949|CT48
alias name:
cancer/testis antigen 48
entrez id:
133482
ensembl gene id:
ENSG00000205359
ucsc gene id:
uc003knp.4
refseq accession:
NM_173488
hgnc_id:
HGNC:23613
approved reserved:
2003-11-25

基因染色体位置

基因染色体位置

5q21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SLCO6A1（溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员6A1）属于SLCO基因家族，也称为有机阴离子转运多肽（OATP）家族。该家族主要编码膜转运蛋白，负责介导多种内源性和外源性物质的跨膜运输，如胆汁酸、激素、药物和其他有机阴离子。SLCO6A1主要在睾丸中高表达，可能参与生殖系统的物质转运，但其具体生物学功能尚未完全阐明。研究表明，SLCO6A1可能通过转运类固醇激素（如睾酮）或其他信号分子，影响精子发生或激素调节。目前关于SLCO6A1突变的研究较少，但SLCO家族其他成员的突变常导致转运功能异常，可能引发药物代谢障碍或疾病（如高胆红素血症）。若SLCO6A1过表达，可能干扰激素平衡或药物分布；而表达降低可能影响睾丸局部微环境稳态。SLCO基因家族的共性包括：具有12个跨膜结构域、依赖钠离子或pH梯度的转运机制、广泛的底物特异性及组织特异性表达模式。SLCO6A1与某些癌症（如前列腺癌）的关联性正在探索中，可能通过影响雄激素转运参与肿瘤进展。需要注意的是，当前对SLCO6A1的研究仍处于早期阶段，其精确功能机制和病理学意义需进一步验证。

None

无

OMIM数据库中对SLCO6A1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SLCO6A1基因的介绍

基因序列

基因序列

SLCO6A1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLCO6A1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs896546       rs974132       rs974133       rs981988       rs1117130       rs1117556       rs1118008       rs1120953       rs1376894       rs1376895       rs1376896       rs1376897       rs1376898       rs1376899       rs1376905       rs1376906       rs1376907      

基因表达

基因表达

SLCO6A1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAGAACACTGACTTCCCAG
59
GCAATCCTGACAATGATGATCC
60
TCATATGTCAAGGTGTGGTG
58
AATGCCAACTTCTCAATGGT
58
AGCTAGGAAACGTAAACAGCT
60
CATCAGAATCCAAAGAGCAGC
60
TTTACTTTCAGGGTTGTACCTG
58
CCAGGAATAGTCCCAAATATTCTC
59
GCTAGGAAACGTAAACAGCT
58
TCATCAGAATCCAAAGAGCAG
58
TACTTTCAGGGTTGTACCTGAC
60
CCAGGAATAGTCCCAAATATTCTC
59
ACTGACTTCCCAGATGTAACTG
60
GCAATCCTGACAATGATGATCC
60
CTCATATGTCAAGGTGTGGT
57
ATGCCAACTTCTCAATGGT
57
TGACAGCAGACTTAAAGATCTG
58
CTGGATTCTTCATCAGAATCCA
58
TCATATGTCAAGGTGTGGTG
58
ATGCCAACTTCTCAATGGT
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SLCO6A1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLCO6A1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005215
C9J020 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9J020 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9J020 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q86UG4 (UniProtKB)
IBA
GO:0015347
Q86UG4 (UniProtKB)
IBA
GO:0043252
Q86UG4 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLCO6A1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.123452799 6 2 BeFree_GAD_GWASCAT
Mental deterioration 0.12 1 1 GWASCAT
Impaired cognition 0.12 1 1 GWASCAT
Breast Carcinoma 0.013843535 51 1 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.013572094 50 1 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.012214884 45 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.011943442 44 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.007600372 28 1 BeFree
Asthma 0.007328931 27 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.007057489 26 1 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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