SLC39A1 (solute carrier family 39 member 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SLC39A1
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.3
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
ZIP1
alias name:
zinc transporter 1|ZRT/IRT-like pr…
entrez id:
27173
ensembl gene id:
ENSG00000143570
ucsc gene id:
uc031ppi.1
refseq accession:
NM_014437
hgnc_id:
HGNC:12876
approved reserved:
2000-02-07

基因染色体位置

基因染色体位置

1q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SLC39A1（溶质载体家族39成员1）属于SLC39基因家族，该家族也称为ZIP（Zrt-/Irt-like protein）转运蛋白家族，主要负责锌、铁等二价金属离子的跨膜转运。SLC39A1编码的蛋白质是一种膜蛋白，主要位于细胞膜或细胞器膜上，其生物学功能是介导锌离子从细胞外或细胞器内转运到细胞质中，维持细胞内锌离子稳态。锌离子作为多种酶的辅因子，参与DNA合成、细胞增殖、免疫调节等重要生理过程。SLC39A1在多种组织中表达，包括肠道、肝脏、肾脏和免疫细胞等，其中肠道是其重要作用位点，参与膳食锌的吸收。SLC39A1突变可能导致锌转运功能障碍，引发锌缺乏相关症状如生长迟缓、免疫功能受损和皮肤病变。研究发现SLC39A1表达异常与某些疾病相关，如炎症性肠病和某些癌症，这可能与其锌转运功能紊乱影响细胞信号通路有关。当SLC39A1过表达时，可能导致细胞内锌离子水平异常升高，进而影响其他依赖锌离子的基因表达和酶活性，甚至引发氧化应激；而表达降低则可能导致锌缺乏，影响细胞正常代谢和免疫功能。SLC39A1所在的ZIP基因家族成员均具有8个跨膜结构域和相似的金属离子结合位点，其共性是通过协同或互补作用调节金属离子在细胞内的分布和平衡。目前关于SLC39A1的研究仍在深入，其在疾病中的具体作用机制尚需进一步阐明。

This gene encodes a member of the zinc-iron permease family. The encoded protein is localized to the cell membrane and acts as a zinc uptake transporter. This gene has been linked to prostate cancer, breast cancer, and Alzheimer's disease. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2012]

该基因编码的锌 - 铁通透家族的一个成员。所编码的蛋白质被定位于细胞膜和充当锌摄取转运蛋白。该基因已与前列腺癌，乳腺癌，和阿尔茨海默氏病。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2012年12月提供]

OMIM数据库中对SLC39A1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SLC39A1基因的介绍

基因序列

基因序列

SLC39A1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SLC39A1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs4845586       rs6657534       rs6659056       rs6661009       rs11264736       rs11264743       rs11288257       rs12023699       rs12027029       rs12402829       rs28654266       rs34612917       rs34772253       rs45600231       rs61805525       rs74369324       rs76935645      

基因表达

基因表达

SLC39A1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTTAAGAAGTCGCCTGCT
57
ATGATGCTTCTGGTAGCTC
57
CTGAAGCGCTTGTTCTCTG
59
AGTGACTCTCAGACCTGGA
59
TGCTCCTAACTGACGTCAC
60
CAGTGACTCTCAGACCCAC
59
AGTCACTTGGGAAAGAAAGTG
59
CAGTGACTCTCAGACCCAG
59
GAATTCCCGACTCTAGGCC
60
CCAGTGACTCTCAGACCTC
59
CTAACCATGAAGGCTCAGCT
60
CAGGTCCAGGAGACAAGTG
60
TGCTCCTAACTGACGTCAC
60
CAGTGACTCTCAGACCCAC
59
CGGCCTCTACATTCCTTAGG
60
CTCTCAGACCCTTTCACCTG
60
GAATTCCCGACTCTAGGCC
60
CCAGTGACTCTCAGACCTC
59
CTGAAGCGCTTGTTCTCTG
59
AGTGACTCTCAGACCTGGA
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
CREB1
SLC39A1
Unknown
19026724
SP1
SLC39A1
Unknown
19026724

基因本体信息

SLC39A1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC39A1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A0A0MTL8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5T4K2 (UniProtKB)
IEA
GO:0030001
Q5T4K2 (UniProtKB)
IEA
GO:0046873
Q5T4K2 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
Q5T4K2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5T4K3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030001
Q5T4K3 (UniProtKB)
IEA
GO:0046873
Q5T4K3 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
Q5T4K3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5T4K4 (UniProtKB)
IEA
GO:0030001
Q5T4K4 (UniProtKB)
IEA
GO:0046873
Q5T4K4 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
Q5T4K4 (UniProtKB)
IEA
GO:0001701
Q9NY26 (UniProtKB)
IEA
GO:0005102
Q9NY26 (UniProtKB)
IEA
GO:0005385
Q9NY26 (UniProtKB)
IBA
GO:0005385
Q9NY26 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
Q9NY26 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9NY26 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9NY26 (UniProtKB)
TAS
GO:0006812
Q9NY26 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
Q9NY26 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q9NY26 (UniProtKB)
IEA
GO:0022890
Q9NY26 (UniProtKB)
TAS
GO:0048701
Q9NY26 (UniProtKB)
IEA
GO:0060173
Q9NY26 (UniProtKB)
IEA
GO:0071577
Q9NY26 (UniProtKB)
IMP
GO:0071577
Q9NY26 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SLC39A1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.128444493 5 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Respiratory Hypersensitivity 0.12 1 0 CTD_human
Prostate carcinoma 0.001900093 7 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.001900093 7 0 BeFree
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.000542884 2 0 BeFree
Cystic Fibrosis 0.000542884 2 0 BeFree
Conventional (Clear Cell) Renal Cell Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Xenograft Model 0.000271442 1 0 BeFree
Exanthema 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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