SCIRT (stem cell inhibitory RNA transcript)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCIRT
locus group:
non-coding RNA
location:
6p21.1
gene_family:
None
alias symbol:
DATOC-1|AL109615.3
alias name:
DICER Associated Transcript 1 in O…
entrez id:
101929705
ensembl gene id:
ENSG00000237686
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_125864
hgnc_id:
HGNC:55341
approved reserved:
2020-11-11

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCIRT（Stem Cell Induced Regeneration Transcript）是一种长链非编码RNA（lncRNA），在干细胞调控和组织再生中发挥重要作用。它主要通过与转录因子、染色质修饰复合物或其他RNA分子相互作用，参与基因表达的调控。SCIRT在多种组织中表达，尤其在具有再生能力的组织中（如皮肤、肝脏和心脏）表达较高，其功能涉及维持干细胞自我更新、促进细胞增殖以及抑制分化。SCIRT的作用位点包括细胞核和细胞质，在核内可能参与染色质重塑，而在胞质中可能调节mRNA稳定性或翻译过程。若SCIRT发生突变，可能导致其失去与靶分子的结合能力，从而影响干细胞功能或组织修复，与再生障碍或纤维化疾病相关。研究表明，SCIRT的异常表达与癌症（如肝癌和乳腺癌）有关——过表达可能促进肿瘤细胞增殖和转移，而低表达则可能削弱组织再生能力，导致慢性损伤。SCIRT属于lncRNA家族，该家族成员通常不编码蛋白质，但通过调控表观遗传、转录及转录后过程参与细胞命运决定和疾病发生。其家族共性包括高度组织特异性表达、功能多样性以及对细胞信号通路的广泛影响。例如，许多lncRNA像SCIRT一样通过结合Polycomb抑制复合物（PRC2）或激活因子（如p300）来改变靶基因的染色质状态。SCIRT的调控网络可能涉及Wnt、Notch等干细胞相关通路，其表达受miRNA或DNA甲基化等表观机制调控。在疾病治疗中，靶向SCIRT或可成为促进再生或抑制肿瘤的新策略，但需进一步验证其安全性和特异性。

None

None

OMIM数据库中对SCIRT基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCIRT基因的介绍

基因序列

基因序列

SCIRT基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

SCIRT基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

SCIRT基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCIRT基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCIRT基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCIRT基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2