SCAT1 (S-phase cancer associated transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

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SCAT1
locus group:
non-coding RNA
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17q25.3
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CTD-2357A8.3|XLOC_012582
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HGNC:52930
approved reserved:
2016-12-20

基因染色体位置

基因染色体位置

17q25.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCAT1（Solute Carrier Family 1 Member 1）属于溶质载体家族1（SLC1），也称为兴奋性氨基酸转运体家族（EAATs）。该家族主要负责神经系统中谷氨酸和天冬氨酸等兴奋性氨基酸的转运，对维持突触间隙中谷氨酸的浓度至关重要，从而调控神经信号传递。SCAT1（即EAAT3）主要在神经元中表达，尤其在突触后膜上，参与谷氨酸的再摄取以防止神经毒性。其功能特点包括依赖钠离子和钾离子的电化学梯度进行谷氨酸转运，同时伴随氢离子的反向运输。SCAT1的突变可能导致转运功能异常，与多种神经系统疾病相关，如癫痫、精神分裂症和阿尔茨海默病。突变可能降低谷氨酸清除效率，导致突触间隙谷氨酸积累，引发兴奋性毒性神经元损伤。SCAT1过表达可能增强谷氨酸再摄取，减少神经兴奋性毒性，但过度抑制谷氨酸信号可能影响突触可塑性。反之，表达降低会导致谷氨酸清除不足，增加神经退行性疾病风险。SLC1家族成员（如EAAT1-5）均具有类似的跨膜结构和谷氨酸转运功能，但组织分布和动力学特性不同。SCAT1在肠道和肾脏也有表达，参与氨基酸吸收和酸碱平衡调节。研究表明，SCAT1与糖尿病和癌症的代谢异常可能相关，但机制尚不明确。该基因的调控涉及转录因子如NF-κB和表观遗传修饰，其表达水平变化可能影响其他神经递质系统的平衡。

None

None

OMIM数据库中对SCAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

SCAT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

SCAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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