RPL27A (ribosomal protein L27a)

symbol:
RPL27A
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.4
gene_family:
L ribosomal proteins
alias symbol:
L27A
alias name:
None
entrez id:
6157
ensembl gene id:
ENSG00000166441
ucsc gene id:
uc001mgs.5
refseq accession:
NM_000990
hgnc_id:
HGNC:10329
approved reserved:
1997-07-07
11p15.4
基因染色体位置图

RPL27A(核糖体蛋白L27a)是核糖体蛋白家族的一员,属于核糖体大亚基(60S)的组成部分。核糖体是细胞内负责蛋白质合成的分子机器,由RNA和蛋白质共同构成。RPL27A作为核糖体的结构蛋白,参与维持核糖体的稳定性,并在翻译过程中帮助mRNA解码和肽链延伸。该基因在几乎所有真核生物中高度保守,表明其功能的重要性。RPL27A的表达水平通常与细胞增殖相关,在快速分裂的细胞(如癌细胞)中可能上调。若RPL27A发生突变,可能导致核糖体组装异常或功能缺陷,进而影响全局蛋白质合成,引发核糖体病(ribosomopathy)。这类疾病常表现为发育异常、贫血或癌症易感性增加,例如Diamond-Blackfan贫血(一种先天性骨髓衰竭综合征)就与核糖体蛋白基因突变相关。RPL27A过表达可能通过增强蛋白质合成促进肿瘤生长,而低表达则可能导致细胞周期阻滞或凋亡。该基因属于RPL(核糖体大亚基蛋白)基因家族,该家族成员均参与核糖体大亚基的构建,具有高度保守的碱性氨基酸序列特征,多数能与rRNA相互作用。研究还发现RPL27A可能具有核糖体之外的"兼职功能"(moonlighting function),如参与DNA损伤修复或调控特定mRNA的翻译效率。在癌症中,RPL27A常被作为预后标志物,其表达水平与多种肿瘤(如乳腺癌、肝癌)的进展和化疗耐药性相关。最新研究提示RPL27A可能通过影响p53(一种重要的抑癌蛋白)通路参与肿瘤发生。需要注意的是,核糖体蛋白基因突变通常产生组织特异性表型,这与"核糖体异质性"(不同细胞类型含有特定组成的核糖体)理论相关。

Ribosomes, the organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 60S subunit. The protein belongs to the L15P family of ribosomal proteins. It is located in the cytoplasm. Variable expression of this gene in colorectal cancers compared to adjacent normal tissues has been observed, although no correlation between the level of expression and the severity of the disease has been found. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, multiple processed pseudogenes derived from this gene are dispersed through the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

核糖体,催化蛋白质合成的细胞器,由一个小40S亚基和60S大亚基。一起这些亚基组成的4 RNA种类和大约80结构不同的蛋白质。该基因编码一种核糖体蛋白,它是60S亚基的一个组成部分。该蛋白属于L15P家族核糖体的蛋白质。它位于细胞质中。该基因在相比邻近正常组织的结肠直肠癌的可变表达已经观察到,虽然表达水平与疾病的严重程度之间没有相关性已被发现。作为典型编码核糖体蛋白的基因,从该基因的多个经处理的假通过基因组分散。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

RPL27A基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
RPL27A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3365       rs4670       rs6735       rs1057198       rs1135249       rs2036422       rs2073684       rs2073685       rs2073686       rs3833782       rs3841218       rs7925000       rs7941749       rs7945657       rs7951084       rs10769940       rs10769941      

RPL27A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAACATGCCATCCAGACTG
59
TTGTCGAAGTTGATCCGGT
59
CTTCGACAAATACCACCCAG
59
GTCAAGGTTGACAGTTGGG
59
ATCTTCGAGATGGGAACCT
58
GCTTGTCCAAAGAATTAACTCC
58
GACAAATATGAACAGACACGG
57
TCCCAGAACTTTGTAGTAGC
57
ACTTTGGTCAGTGAACAGAC
58
CTTTGTAGTAGCCCGATCG
58
GATCAACTTCGACAAATAGGCT
59
AATTTGGCCTTCACGATGAC
59
ACATGCCATCCAGACTGAG
60
CCAGACTAGCTAAGCACCC
60
CGACAAATATGAACAGACACG
58
CCCAGAACTTTGTAGTAGCC
58
TTTGGTCAGTGAACAGACAC
58
CTTTGTAGTAGCCCGATCG
58
CAACATGCCATCCAGACTG
59
TAGCTAAGCACCCGAAGAG
59
      尚未收录相关数据

RPL27A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RPL27A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003735
E9PJD9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005840
E9PJD9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006412
E9PJD9 (UniProtKB)
IEA
GO:0003735
E9PLX7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005840
E9PLX7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006412
E9PLX7 (UniProtKB)
IEA
GO:0000184
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0003723
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0003735
P46776 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
P46776 (UniProtKB)
IPI
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0006364
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0006412
P46776 (UniProtKB)
NAS
GO:0006413
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0006614
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
P46776 (UniProtKB)
IDA
GO:0019083
P46776 (UniProtKB)
TAS
GO:0022625
P46776 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
P46776 (UniProtKB)
IDA

可能调控 RPL27A基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pancytopenia 0.12 1 0 CTD_human
Hyperpigmentation 0.12 1 0 CTD_human
Cerebellar Ataxia 0.12 1 0 CTD_human

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。