RHBDF2 (rhomboid 5 homolog 2)

symbol:
RHBDF2
locus group:
protein-coding gene
location:
17q25.1
gene_family:
Rhomboid family
alias symbol:
FLJ22341|RHBDL5|TOCG|iRhom2
alias name:
None
entrez id:
79651
ensembl gene id:
ENSG00000129667
ucsc gene id:
uc060kji.1
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NM_024599
hgnc_id:
HGNC:20788
approved reserved:
2004-07-07
17q25.1
基因染色体位置图

RHBDF2(Rhomboid 5 Homolog 2)属于Rhomboid蛋白酶家族,该家族成员是一类膜内丝氨酸蛋白酶,主要参与蛋白质的切割和激活过程。RHBDF2在细胞膜或内质网膜上发挥作用,通过调控底物蛋白的切割来影响信号传导途径,尤其是表皮生长因子受体(EGFR)的激活。该基因在皮肤、心脏和免疫系统中表达较高,其功能与组织修复、炎症反应和细胞增殖密切相关。RHBDF2的突变可能导致TOC(Tylosis with Esophageal Cancer)综合征,表现为手掌和脚底过度角化以及食管癌风险增加,这是因为突变影响了其正常切割功能,导致EGFR信号通路异常激活。此外,RHBDF2还与慢性炎症性疾病和某些癌症的发展相关。如果RHBDF2过表达,可能过度激活EGFR等信号通路,促进细胞异常增殖和肿瘤发生;而降低表达则可能削弱组织修复能力或导致免疫功能紊乱。Rhomboid基因家族的共性在于它们都含有保守的催化核心结构,能够切割跨膜蛋白的胞内段,从而释放活性片段或调节受体功能。这一家族在进化上高度保守,广泛参与发育、免疫和代谢调控等关键生物学过程。

None

RHBDF2基因的碱基序列:[NCBI]
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RHBDF2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs8150       rs2289801       rs2289802       rs7216872       rs7221225       rs8071747       rs8073245       rs11553544       rs73998911       rs77076744       rs111924263       rs116097888       rs137910466       rs143692182       rs182666434       rs190511294       rs193028838      

RHBDF2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACCTCTCCATCACCATCC
59
AAGTAGGCTGGGTTCTTCC
59
ATCCCTCTGAAGGAGTATGG
58
CAAAGTGCTTCACCTTGGA
58
TCTAAAGCCCTTCACAGCA
59
TCCTACCTTCGAGTCTGAG
58
AACCTCTCCATCACCATCC
59
CTGGGTTCTTCCTCTCAGG
59
GCAAACTCAGACTCGAAGC
59
CATTCTTGTCAGCAGAGGC
59
TCTCTTCCTACATGCTGGC
59
AGGATGGTCATTTGAAAGACC
58
CATGCTCTAAAGCCCTTCAC
59
CCTTCGAGTCTGAGTTTGC
59
AATCCCTCTGAAGGAGTATGG
59
AAAGTGCTTCACCTTGGAG
58
CTGCCTGAGAGGAAGAACC
60
CGCTTCTCTGAACTCTCCT
59
TCTCTTCCTACATGCTGGC
59
GGATGGTCATTTGAAAGACCA
59
      尚未收录相关数据

RHBDF2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RHBDF2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004252
K7EKI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
K7EKI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
K7EKI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004252
K7EPN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
K7EPN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
K7EPN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004252
K7EPV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
K7EPV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
K7EPV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005789
Q6PJF5 (UniProtKB)
ISS
GO:0005789
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q6PJF5 (UniProtKB)
IDA
GO:0015031
Q6PJF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q6PJF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0019838
Q6PJF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0042058
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0050708
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0050709
Q6PJF5 (UniProtKB)
ISS
GO:0004252
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA
GO:0016485
Q6PJF5 (UniProtKB)
IBA

可能调控 RHBDF2基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
TYLOSIS WITH ESOPHAGEAL CANCER 0.360271442 2 2 BeFree_CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
PALMOPLANTAR KERATODERMA, NONEPIDERMOLYTIC 0.002442977 9 0 BeFree
Keratoderma, Palmoplantar, Diffuse 0.002442977 9 0 BeFree
Hyperkeratosis 0.002442977 9 0 BeFree
Malignant neoplasm of esophagus 0.002171535 8 0 BeFree
Extraskeletal Myxoid Chondrosarcoma 0.002171535 8 0 BeFree
Esophageal carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Esophageal Neoplasms 0.001085767 4 0 BeFree
Chondrosarcoma 0.000814326 3 0 BeFree

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