RGMA (repulsive guidance molecule BMP co-receptor a)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RGMA
locus group:
protein-coding gene
location:
15q26.1
gene_family:
alias symbol:
RGM
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None
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56963
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ENSG00000182175
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uc002bss.3
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NM_020211
hgnc_id:
HGNC:30308
approved reserved:
2004-02-04

基因染色体位置

基因染色体位置

15q26.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

RGMA（Repulsive Guidance Molecule A）是一种属于排斥性导向分子（RGM）家族的基因，该家族还包括RGMB和RGMC（又称HFE2）。RGM家族成员在神经发育、轴突导向和铁代谢调节中发挥重要作用，它们都是糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定的膜蛋白，通过结合特定的受体（如Neogenin和BMP受体）传递信号。RGMA主要在神经系统高表达，尤其在发育中的中枢神经系统，它通过排斥性导向作用参与轴突生长锥的导向，帮助建立正确的神经连接。RGMA还参与神经元存活、突触可塑性和髓鞘形成。在成年后，RGMA表达水平下降，但在某些病理条件下（如神经损伤或炎症）可能重新上调。RGMA的突变或表达异常与多种神经系统疾病相关，如多发性硬化症、肌萎缩侧索硬化症（ALS）和脊髓损伤后的神经再生障碍。研究表明，RGMA过表达会抑制轴突再生，这可能通过激活RhoA/ROCK信号通路实现，而降低RGMA表达或使用中和抗体可促进轴突再生和功能恢复。此外，RGMA在癌症中也有研究，某些肿瘤中RGMA表达上调可能与肿瘤进展和转移相关。在铁代谢方面，RGMA通过与Neogenin和铁调素（Hepcidin）相互作用，间接影响铁稳态。RGMA的功能多样性使其成为神经再生和铁代谢相关疾病的潜在治疗靶点。

This gene encodes a member of the repulsive guidance molecule family. The encoded protein is a glycosylphosphatidylinositol-anchored glycoprotein that functions as an axon guidance protein in the developing and adult central nervous system. This protein may also function as a tumor suppressor in some cancers. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009]

该基因编码的排斥导向分子家族的一个成员。编码的蛋白是一种糖基锚定的糖蛋白，其功能如同在发展中国家和成人中枢神经系统轴突导向蛋白。这种蛋白也可以用作在一些癌症肿瘤抑制。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2009年10月提供]

OMIM数据库中对RGMA基因的介绍     Wikipedia数据库中对RGMA基因的介绍

基因序列

基因序列

RGMA基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RGMA基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8038770       rs35398061       rs55724589       rs56761079       rs60048376       rs60714695       rs62045493       rs62045494       rs62045495       rs62045496       rs72649531       rs73460353       rs73460356       rs74029243       rs78089075       rs111706342       rs112306026      

基因表达

基因表达

RGMA基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCCTTCTCTGCAGCTTCC
60
CTCAGAGTTGCACTTGAGGA
60
CAGAGGGACAGAAGGAAGG
59
TGCACTTGAGGATCTTGCA
60
ACTCTTCTTCCAGGGAGAG
58
TTTAATAGCTGTCTGCGGG
58
CTAGTGGTAACAGGCCGAG
60
GAAGATGATGGTGAGCTGC
59
TAATTACCTGAACGTGCAGG
58
GATGATGGTGAGCTTGCTG
59
ATTACCTGAACGTGCAGGT
59
AGATGATGGTGAGCTTGCT
59
CAGAGGGACAGAAGGAAGG
59
GCACTTGAGGATCTTGCAC
59
CTCTTCTTCCAGGGAGAGG
59
TTTAATAGCTGTCTGCGGG
58
TTCCTTCTCTGCAGCTTCC
60
CTCAGAGTTGCACTTGAGG
58
CTGGATGGATGGGTATGGG
59
CTTGAAGATGATGGTGAGCTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RGMA基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RGMA基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001843
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0009986
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0010976
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0015026
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0030509
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0030510
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0043005
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048671
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048681
A0A0A0MTQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0001948
Q96B86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96B86 (UniProtKB)
IPI
GO:0005783
Q96B86 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q96B86 (UniProtKB)
IBA
GO:0015026
Q96B86 (UniProtKB)
IBA
GO:0030509
Q96B86 (UniProtKB)
IBA
GO:0031225
Q96B86 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q96B86 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q96B86 (UniProtKB)
IDA
GO:1990459
Q96B86 (UniProtKB)
IPI

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RGMA基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Multiple Sclerosis 0.082909916 3 0 BeFree_GAD_RGD
Epilepsy, Temporal Lobe 0.08 1 0 RGD
Infarction, Middle Cerebral Artery 0.08 2 0 RGD
Sciatic Neuropathy 0.08 1 0 RGD
Trauma, Nervous System 0.00272435 1 0 LHGDN
Mental Depression 0.002367032 1 0 GAD
Kidney Failure, Chronic 0.000542884 2 2 BeFree
Kidney Failure 0.000542884 2 2 BeFree
Experimental Autoimmune Encephalomyelitis 0.000271442 1 0 BeFree
Moderate mental retardation (I.Q. 35-49) 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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