PTPRR (protein tyrosine phosphatase receptor type R)

symbol:
PTPRR
locus group:
protein-coding gene
location:
12q15
gene_family:
Protein tyrosine phosphatases, receptor type
alias symbol:
PTPBR7|PTP-SL|EC-PTP|PCPTP1
alias name:
None
entrez id:
5801
ensembl gene id:
ENSG00000153233
ucsc gene id:
uc001swi.3
refseq accession:
NM_002849
hgnc_id:
HGNC:9680
approved reserved:
1999-10-28
12q15
基因染色体位置图

PTPRR(Protein Tyrosine Phosphatase Receptor Type R)属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)基因家族,该家族成员通过去磷酸化调控细胞信号转导,影响细胞增殖、分化、凋亡等过程。PTPRR主要在神经系统高表达,尤其是大脑皮层、海马和小脑,参与神经元发育和突触可塑性调控。其编码的蛋白含有胞外纤维连接蛋白III型结构域、跨膜区和胞内催化结构域,通过负调控MAPK/ERK信号通路(主要作用于ERK1/2)维持神经兴奋性平衡。突变可能导致催化活性丧失或定位异常,与癫痫、精神分裂症等神经精神疾病相关。动物模型中PTPRR缺失会引发ERK信号过度激活,导致海马依赖性学习记忆增强但伴随焦虑样行为;而过表达则抑制ERK通路,影响神经元突触形成。该基因与家族成员PTPRD、PTPRF共享调控神经元轴突导向的共性,但PTPRR对ERK的特异性抑制是其独特特征。此外,PTPRR在胶质瘤中常发生表观遗传沉默,其表达降低会促进肿瘤细胞侵袭,而恢复表达可抑制MAPK驱动的肿瘤进展。

The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and a single intracellular catalytic domain, and thus represents a receptor-type PTP. Silencing of this gene has been associated with colorectal cancer. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. This gene shares a symbol (PTPRQ) with another gene, protein tyrosine phosphatase, receptor type, Q (GeneID 374462), which is also located on chromosome 12. [provided by RefSeq, May 2011]

由该基因编码的蛋白质是蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的一个成员。的PTPs已知是信令调节多种细胞过程,包括细胞生长,分化,有丝分裂周期,和致癌性转化的分子。此PTP具有一个胞外区,一个跨膜区和一个胞内催化域,并因此代表了受体型PTP。这个基因的沉默已与结肠癌有关。已发现该基因编码不同亚型的多个抄本变形。该基因的股票符号(PTPRQ)与另一基因,蛋白酪氨酸磷酸酶,受体型,Q(GeneID 374462),它也位于[由RefSeq的,2011年5月提供] 12号染色体

PTPRR基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
PTPRR基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs972769       rs988342       rs988343       rs1028039       rs1040021       rs1040022       rs1355702       rs1398598       rs1398599       rs1398600       rs1513095       rs1513096       rs1513097       rs1513098       rs1513099       rs1513100       rs1513101      

PTPRR基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACAAGACTCCAGACAGTG
59
CTATTCCTGCACTGCAGTG
58
CTGAGATCAAAGCTACCACC
58
TACGTTGGACCCTCTTCTC
58
GAGATCAAAGCTACCACCG
58
ATACGTTGGACCCTCTTCTC
59
ACAAGACTCCAGACAGTGC
59
ACCTATTCCTGCACTGCAG
59
GAGATCAAAGCTACCACCG
58
TACGTTGGACCCTCTTCTC
58
CACAAGACTCCAGACAGTG
57
CTATTCCTGCACTGCAGTG
58
      尚未收录相关数据

PTPRR基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PTPRR基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004725
F8VU63 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
F8VU63 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
F8VVE9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
F8VVE9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
F8VVE9 (UniProtKB)
IDA
GO:0030054
F8VVE9 (UniProtKB)
IDA
GO:0035335
F8VVE9 (UniProtKB)
IEA
GO:0001701
Q15256 (UniProtKB)
IEP
GO:0004725
Q15256 (UniProtKB)
TAS
GO:0005001
Q15256 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q15256 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q15256 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q15256 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
Q15256 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q15256 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q15256 (UniProtKB)
IDA
GO:0006470
Q15256 (UniProtKB)
TAS
GO:0010633
Q15256 (UniProtKB)
IMP
GO:0016021
Q15256 (UniProtKB)
IEA
GO:0019901
Q15256 (UniProtKB)
ISS
GO:0030054
Q15256 (UniProtKB)
IDA
GO:0030182
Q15256 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
Q15256 (UniProtKB)
IEA
GO:0038128
Q15256 (UniProtKB)
IMP
GO:0048471
Q15256 (UniProtKB)
IEA
GO:0070373
Q15256 (UniProtKB)
IMP
GO:1903385
Q15256 (UniProtKB)
IMP

可能调控 PTPRR基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Refractive Errors 0.12 1 1 GWASCAT
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Parkinson Disease 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Hearing Loss, Mixed Conductive-Sensorineural 0.000542884 2 0 BeFree
Myopia 0.000271442 1 0 BeFree
Nonsyndromic Deafness 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。