PTPRH (protein tyrosine phosphatase receptor type H)

symbol:
PTPRH
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.42
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|Protein tyrosine phosphatases, receptor type
alias symbol:
SAP-1
alias name:
None
entrez id:
5794
ensembl gene id:
ENSG00000080031
ucsc gene id:
uc002qjq.4
refseq accession:
NM_001161440
hgnc_id:
HGNC:9672
approved reserved:
1994-09-14
19q13.42
基因染色体位置图

PTPRH(Protein Tyrosine Phosphatase Receptor Type H)是一种受体型蛋白酪氨酸磷酸酶,属于PTP(Protein Tyrosine Phosphatase)基因家族。该家族的主要功能是通过去磷酸化调控细胞内的信号转导,与蛋白酪氨酸激酶(PTK)共同维持细胞内磷酸化平衡,影响细胞增殖、分化、迁移和凋亡等过程。PTPRH在多种组织中表达,尤其在肝脏、肠道和胰腺中表达较高,其胞外区含有纤维连接蛋白III型重复序列,可能参与细胞间或细胞与基质的相互作用。PTPRH通过去磷酸化底物蛋白(如生长因子受体或黏附分子)调控下游信号通路,例如可能抑制EGFR等受体酪氨酸激酶的活性,从而影响细胞生长和肿瘤发生。研究表明,PTPRH的突变或表达异常与多种癌症相关,如肝癌、结肠癌和胰腺癌。其功能丧失可能导致酪氨酸磷酸化水平升高,促进细胞异常增殖和肿瘤进展;而过表达可能抑制致癌信号通路,但具体机制仍需进一步研究。PTPRH所在的PTP家族包含经典和非经典成员,均具有保守的催化结构域,但受体型(如PTPRH)通常具有跨膜区和胞外区,参与细胞外信号感知。该基因的调控异常可能影响其他相关基因(如MAPK或PI3K通路成员)的表达或活性,进而干扰细胞稳态。目前,PTPRH作为潜在肿瘤抑制因子或治疗靶点受到关注,但其在特定组织中的精确功能及调控网络仍需深入探索。

The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and a single intracytoplasmic catalytic domain, and thus represents a receptor-type PTP. The extracellular region contains eight fibronectin type III-like repeats and multiple N-glycosylation sites. The gene was shown to be expressed primarily in brain and liver, and at a lower level in heart and stomach. It was also found to be expressed in several cancer cell lines, but not in the corresponding normal tissues. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2009]

由该基因编码的蛋白质是蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的一个成员。的PTPs已知是信令调节多种细胞过程,包括细胞生长,分化,有丝分裂周期,和致癌性转化的分子。此PTP具有一个胞外区,一个跨膜区和一个胞质内催化域,并因此代表了受体型PTP。胞外区包含八个纤连蛋白III型样重复和多个N-糖基化位点。该基因被示出主要在脑和肝中表达,并在心脏和胃一个较低的水平。还发现在一些肿瘤细胞系中表达,而不是在对应的正常组织。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2009年06月提供]

PTPRH基因的碱基序列:[NCBI]
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PTPRH基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs17458       rs876515       rs890870       rs1136578       rs2042907       rs2288419       rs2288420       rs2288515       rs2288516       rs2288517       rs2288518       rs2288519       rs2288520       rs2288521       rs2288522       rs2288523       rs2288524      

PTPRH基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAATGGAATCAACAGCTCC
58
TTCCTCACTGGGTTGTGAG
59
GTACAATTTCACCGTGTGGG
60
TGTGTCTGGGTATGTGGAC
59
CTCGAAGAGACCTTCCTTCC
60
GTTCTGTGAGTCTAGGCCA
59
TGACCTTCCTTCCCAATTCTC
60
TCTGAGTCTCCACTGTCAG
58
GGAGTAAATAGCTCTGTGGG
58
ACTCTCAGGTTCCTCACTG
58
GAATGGAATCAACAGCTCCC
59
TTCCTCACTGGGTTGTGAG
59
TCGAAGAGACCTTCCTTCC
58
GTTCTGTGAGTCTAGGCCA
59
CGGAGTAAATAGCTCTGTGG
58
CTCTCAGGTTCCTCACTGG
59
GACCTTCCTTCCCAATTCTC
58
TCTGAGTCTCCACTGTCAG
58
TACAATTTCACCGTGTGGG
58
CTGTGTCTGGGTATGTGGA
59
      尚未收录相关数据

PTPRH基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PTPRH基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005001
Q9HD43 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9HD43 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HD43 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HD43 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q9HD43 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q9HD43 (UniProtKB)
TAS
GO:0006470
Q9HD43 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
Q9HD43 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
Q9HD43 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
Q9HD43 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PTPRH基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Oral candidiasis 0.000542884 2 0 BeFree
Candidiasis of vagina 0.000542884 2 0 BeFree
Sepsis 0.000542884 2 0 BeFree
Cutaneous Candidiasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malaria 0.000271442 1 0 BeFree
Infective vaginitis 0.000271442 1 0 BeFree
Leukodystrophy, Metachromatic 0.000271442 1 0 BeFree
Vaginal Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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