PTPRG (protein tyrosine phosphatase receptor type G)

symbol:
PTPRG
locus group:
protein-coding gene
location:
3p14.2
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|Protein tyrosine phosphatases, receptor type
alias symbol:
RPTPG
alias name:
None
entrez id:
5793
ensembl gene id:
ENSG00000144724
ucsc gene id:
uc003dlb.4
refseq accession:
NM_002841
hgnc_id:
HGNC:9671
approved reserved:
1991-05-15
3p14.2
基因染色体位置图

PTPRG(Protein Tyrosine Phosphatase Receptor Type G)是一种属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的基因,该家族的主要功能是通过去磷酸化调控细胞内的信号转导,影响细胞生长、分化、代谢和免疫反应等过程。PTPRG是一种跨膜受体型磷酸酶,其结构包括胞外区、跨膜区和胞内催化区,主要通过与细胞外配体结合并调控胞内酪氨酸激酶信号通路(如EGFR、PDGFR等)来发挥作用。PTPRG在多种组织中表达,尤其在神经系统、肾脏和肺中表达较高,参与神经元发育、突触可塑性及细胞粘附等生物学过程。PTPRG的突变或表达异常可能导致其磷酸酶活性丧失或功能紊乱,进而影响下游信号通路。研究发现,PTPRG的失活突变与多种癌症(如肺癌、胶质瘤和白血病)的发生发展相关,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤进展。此外,PTPRG的异常表达还与神经精神疾病(如精神分裂症)和代谢性疾病有关。当PTPRG过表达时,可能过度抑制生长因子信号通路,导致细胞分化异常或凋亡增加;而低表达则可能解除对致癌通路的抑制,促进肿瘤发生。PTPRG属于PTPR(Protein Tyrosine Phosphatase Receptor)亚家族,该家族成员均具有高度保守的催化结构域,并通过去磷酸化负调控酪氨酸激酶介导的信号传导。PTPRG与其他家族成员(如PTPRA、PTPRB)在功能上存在冗余,但也具有组织特异性表达和独特底物选择性的特点。研究PTPRG的调控机制及其与疾病的关联,可能为开发靶向治疗策略提供新方向。

The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and two tandem intracytoplasmic catalytic domains, and thus represents a receptor-type PTP. The extracellular region of this PTP contains a carbonic anhydrase-like (CAH) domain, which is also found in the extracellular region of PTPRBETA/ZETA. This gene is located in a chromosomal region that is frequently deleted in renal cell carcinoma and lung carcinoma, thus is thought to be a candidate tumor suppressor gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的一个成员。的PTPs已知是信令调节多种细胞过程,包括细胞生长,分化,有丝分裂周期,和致癌性转化的分子。此PTP具有一个胞外区,一个跨膜区和两个串联胞质内催化域,并因此代表了受体型PTP。此PTP的胞外区含有碳酸酐酶样(CAH)域,这也是在PTPRBETA / ZETA的胞外区中。该基因位于该在肾细胞癌和肺癌频繁删除??一个染色体区域,从而被认为是一个候选的肿瘤抑制基因。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

PTPRG基因的碱基序列:[NCBI]
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PTPRG基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1007554       rs1007555       rs1567274       rs4688123       rs4688124       rs9836300       rs9863731       rs10510873       rs11924391       rs12630554       rs12630600       rs17685418       rs57970820       rs71296761       rs71629157       rs73840271       rs73840284      

PTPRG基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTTCTATGTGGAAGACAGCAG
58
CCATGTCATCCGGAATAGGA
59
ATTATGTCGTGTGCTTCCC
57
GTGTCTATTCTCGTGCAGG
58
TTCCTATTCCGGATGACATGG
59
GCTGGTTATTAGAATAGAGCTCAC
59
CATTATGTCGTGTGCTTCCC
59
TGTCTATTCTCGTGCAGGG
59
ATTATGTCGTGTGCTTCCC
57
TGTCTATTCTCGTGCAGGG
59
TTTCTATGTGGAAGACAGCAG
58
TCCATGTCATCCGGAATAGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CTCF
PTPRG
Unknown

PTPRG基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PTPRG基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004725
A0A087WWP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WWP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
A0A087WWP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
A0A087X1P0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087X1P0 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
A0A087X1P0 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
P23470 (UniProtKB)
IDA
GO:0005001
P23470 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P23470 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P23470 (UniProtKB)
IPI
GO:0005887
P23470 (UniProtKB)
TAS
GO:0007169
P23470 (UniProtKB)
TAS
GO:0010633
P23470 (UniProtKB)
IMP
GO:0035335
P23470 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
P23470 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
P23470 (UniProtKB)
IPI
GO:0070062
P23470 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P23470 (UniProtKB)
IDA
GO:1903385
P23470 (UniProtKB)
IMP

可能调控 PTPRG基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Neoplasms 0.122995792 1 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Fuchs Endothelial Dystrophy 0.002909916 3 1 BeFree_GAD
Lymphoma, T-Cell, Cutaneous 0.00272435 1 0 LHGDN
Schizophrenia 0.002367032 1 1 GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 1 GAD
Major Depressive Disorder 0.002367032 1 1 GAD
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Bipolar Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree

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