PSCA (prostate stem cell antigen)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PSCA
locus group:
protein-coding gene
location:
8q24.3
gene_family:
alias symbol:
lncPSCA
alias name:
None
entrez id:
8000
ensembl gene id:
ENSG00000167653
ucsc gene id:
uc003ywu.4
refseq accession:
NM_005672
hgnc_id:
HGNC:9500
approved reserved:
1999-08-25

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PSCA（前列腺干细胞抗原）是一种细胞表面糖蛋白，属于LY6/UPAR基因家族，该家族成员通常具有GPI锚定结构域，参与细胞信号传导、免疫调节和细胞黏附等过程。PSCA主要在正常前列腺上皮细胞中表达，但在多种肿瘤组织中也会异常表达，如前列腺癌、膀胱癌、胰腺癌和胃癌等。PSCA的生物学功能尚未完全阐明，但研究表明它可能参与细胞增殖、凋亡抑制和肿瘤转移。PSCA通过与细胞膜上的脂筏结构相互作用，可能影响下游信号通路（如PI3K/AKT和MAPK通路），从而促进肿瘤细胞的存活和侵袭。PSCA的突变或表达异常与多种癌症的发生发展密切相关，例如在前列腺癌中，PSCA的过表达与肿瘤进展和不良预后相关，而在某些胃癌亚型中，PSCA的甲基化导致其表达降低，也可能影响疾病进程。PSCA的过表达可能增强肿瘤细胞的抗凋亡能力和转移潜能，而降低其表达则可能抑制肿瘤生长并增加化疗敏感性。由于PSCA在正常组织中表达有限而在肿瘤中高表达，它已成为癌症免疫治疗（如CAR-T细胞疗法和单克隆抗体）的潜在靶点。LY6/UPAR家族的其他成员（如LY6D、LY6E）也具有类似的GPI锚定结构和参与免疫调节的功能，但各自在特定组织或疾病中的作用有所不同。PSCA的研究为理解肿瘤生物学和开发新型抗癌策略提供了重要线索。

This gene encodes a glycosylphosphatidylinositol-anchored cell membrane glycoprotein. In addition to being highly expressed in the prostate it is also expressed in the bladder, placenta, colon, kidney, and stomach. This gene is up-regulated in a large proportion of prostate cancers and is also detected in cancers of the bladder and pancreas. This gene includes a polymorphism that results in an upstream start codon in some individuals; this polymorphism is thought to be associated with a risk for certain gastric and bladder cancers. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2010]

该基因编码一个糖基锚定的细胞膜糖蛋白。除了在前列腺它也是在膀胱，胎盘，结肠癌，肾癌和胃癌表达被高度表达。该基因是上调大比例的前列腺癌，并在膀胱和胰腺的癌症也检测到。这种基因包括多态性，其导致在一些个人的上游起始密码子;这种多态性被认为是与某些胃和膀胱癌的危险有关。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2010年2月提供]

OMIM数据库中对PSCA基因的介绍     Wikipedia数据库中对PSCA基因的介绍

基因序列

基因序列

PSCA基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PSCA基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2920288       rs2976384       rs2978974       rs4428653       rs4541887       rs4736369       rs9297976       rs10108059       rs10110864       rs12546978       rs13264644       rs60024780       rs60443431       rs72690913       rs73379644       rs73714657       rs75743917      

基因表达

基因表达

PSCA基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTAGATGATTCAGACGATGGG
57
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
ATATAAAGTCACCTGAGGCCC
59
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
TTAGATGATTCAGACGATGGG
57
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
ATATAAAGTCACCTGAGGCCC
59
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
TAGATGATTCAGACGATGGGA
58
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
TAGATGATTCAGACGATGGGA
58
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
TATAAAGTCACCTGAGGCCC
59
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
TATAAAGTCACCTGAGGCCC
59
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
ATAAAGTCACCTGAGGCCC
59
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59
AGATGATTCAGACGATGGGA
58
CTTTGCAGGAGTAGCACAG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
AR
PSCA
Unknown
23330817

基因本体信息

PSCA基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PSCA基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
O43653 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
O43653 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O43653 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O43653 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PSCA基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Duodenal Ulcer 0.243452799 4 1 BeFree_CTD_human_GAD_GWASCAT
Stomach Neoplasms 0.134830952 7 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.128805692 16 6 BeFree_GAD_GWASCAT
Prostatic Neoplasms 0.128444493 5 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Bladder Neoplasm 0.125276948 5 1 BeFree_CTD_human_GAD
Linitis Plastica 0.12 1 0 CTD_human
Malignant neoplasm of stomach 0.009771907 36 8 BeFree
Stomach Carcinoma 0.009771907 36 8 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.009771907 36 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.009229024 34 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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