POTED (POTE ankyrin domain family member D)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
POTED
locus group:
protein-coding gene
location:
21q11.2
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing|POTE ankyrin domain containing
alias symbol:
POTE|POTE-21|POTE21|CT104.1
alias name:
cancer/testis antigen family 104, …
entrez id:
317754
ensembl gene id:
ENSG00000166351
ucsc gene id:
uc002yjb.1
refseq accession:
NM_174981
hgnc_id:
HGNC:23822
approved reserved:
2003-12-15

基因染色体位置

基因染色体位置

21q11.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

POTED（也称为POTE ankyrin domain family member E）属于POTE基因家族，这是一个灵长类特异性的基因家族，其成员在进化过程中通过基因复制和分化形成。POTE基因家族的共性在于它们都含有锚蛋白重复结构域（ankyrin repeat domain），这种结构域通常参与蛋白质之间的相互作用，并在细胞信号传导、细胞周期调控和凋亡等过程中发挥作用。POTE家族基因在多种组织中表达，但在睾丸、卵巢和前列腺等生殖组织中表达较高，提示其可能与生殖系统功能相关。POTED作为该家族的一员，其表达产物可能参与细胞粘附、信号转导或细胞骨架的调控，但具体的生物学功能尚未完全阐明。研究表明，POTE家族基因在某些癌症中异常表达，例如前列腺癌、乳腺癌和卵巢癌，可能与肿瘤的发生和发展有关。POTED的过表达可能促进细胞增殖或抑制凋亡，从而参与肿瘤的恶性转化；而降低表达则可能影响细胞的正常功能，导致生殖系统或其它相关系统的异常。目前关于POTED突变的研究较少，但推测其突变可能破坏蛋白质相互作用，进而影响细胞信号通路或导致疾病。由于POTE家族基因在进化上较新且具有组织特异性，它们可能在某些灵长类特有的生理或病理过程中发挥作用。未来研究需要进一步探索POTED的具体功能、调控机制及其在疾病中的潜在作用，特别是在癌症和生殖系统疾病中的意义。

None

无

OMIM数据库中对POTED基因的介绍     Wikipedia数据库中对POTED基因的介绍

基因序列

基因序列

POTED基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

POTED基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1810857       rs1810858       rs1812282       rs1812283       rs1888392       rs2094851       rs2094852       rs2150356       rs2150358       rs2150359       rs2156111       rs2210202       rs2247342       rs2259257       rs2261599       rs2334576       rs2334577      

基因表达

基因表达

POTED基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCTATCTGGACAGACGGC
60
AAGTCTTGTTCTGGATTGCTG
59
TACAACTCCTGCTGGACAG
59
ATTGTATGGCCTTTATCAGAGC
59
ATCTATCTGGACAGACGGC
59
TGCTTCTTTACCTGGATTGC
59
ATCTATCTGGACAGACGGC
59
AAGTCTTGTTCTGGATTGCTG
59
TCTGATAAAGGCCATACAATGC
59
TCTGGAATATTTCGATCAGCG
58
GATCTATCTGGACAGACGGC
60
GCTTCTTTACCTGGATTGCTG
60
ATCTATCTGGACAGACGGC
59
AGTCTTGTTCTGGATTGCTG
58
CCAGAAAGGATCTCATCGTC
58
CCAAATGTAGAGCAGTCCTC
58
ATCTATCTGGACAGACGGC
59
GCTTCTTTACCTGGATTGCT
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

POTED基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

POTED基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q86YR6 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 POTED基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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