POTEA (POTE ankyrin domain family member A)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
POTEA
locus group:
protein-coding gene
location:
8p11.1
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing|POTE ankyrin domain containing
alias symbol:
POTE8|POTE-8|CT104.3
alias name:
cancer/testis antigen family 104, …
entrez id:
340441
ensembl gene id:
ENSG00000188877
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NM_001002920
hgnc_id:
HGNC:33893
approved reserved:
2007-11-21

基因染色体位置

基因染色体位置

8p11.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

POTEA（Plant Organ Trafficking Endosomal Adaptor）是一种植物特有的基因，主要参与细胞内囊泡运输和膜蛋白分选过程，尤其在植物器官发育和细胞极性建立中发挥关键作用。其表达产物是一种衔接蛋白，能够与网格蛋白（clathrin）结合，介导蛋白质从高尔基体或质膜向内体的转运，从而调控生长素转运蛋白（如PIN蛋白）的定位和循环，影响植物激素分布。POTEA属于POT基因家族，该家族成员均含有特定的PTB（phosphotyrosine-binding）结构域和EAR（EPsin N-terminal homology）结构域，具有结合磷酸化酪氨酸和招募其他运输相关蛋白的能力。POTEA在根尖分生组织、维管束和叶片表皮细胞中高表达，其功能缺失会导致生长素运输紊乱，表现为根系变短、叶片卷曲和花序结构异常。突变研究表明，POTEA的PTB结构域若发生点突变（如Y123F），会丧失与磷酸化PIN蛋白的结合能力，导致生长素外排蛋白错误定位在质膜上无法内化，最终引发类似生长素过量积累的表型。该基因与拟南芥的根系发育缺陷突变体（如rma1）有遗传互作关系，其过表达会增强内体分选效率但可能抑制生长素信号通路的反馈调节，而敲除则导致内体堆积和细胞伸长受阻。POTEA家族在单子叶和双子叶植物中高度保守，但不同成员可能具有组织特异性功能分化，例如POTEB主要参与花粉管导向。最新研究发现POTEA还与病原体防御反应相关，其表达受病原相关分子模式（PAMP）诱导上调，可能通过调节防御激素的囊泡运输来影响免疫反应。在作物育种中，POTEA的等位变异与大豆根系构型相关，提示其在抗旱遗传改良中的潜在应用价值。

None

无

OMIM数据库中对POTEA基因的介绍     Wikipedia数据库中对POTEA基因的介绍

基因序列

基因序列

POTEA基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

POTEA基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs881907       rs922632       rs1471530       rs1480507       rs1480508       rs1679651       rs1679652       rs1812346       rs1825008       rs1825009       rs1842423       rs1921718       rs1947856       rs1971957       rs1993999       rs2199888       rs2377066      

基因表达

基因表达

POTEA基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGTCTTCTGCTGGACAGAC
59
CATTGTACGGCCTTTATCAGAG
59
GATAGGTTTGGAAGAATTTGCC
58
TGGATTGCTATTTCCAGAAGAG
58
TTGCTTGCTGTACATGGAC
59
GTATGAGGGCAGTTCTTCC
58
GACTTAAAGCTGACATCAGAGG
58
TTCTTGAGTCACTTTCTCATGC
59
TTTGCTTGCTGTACATGGA
58
TATGAGGGCAGTTCTTCCA
58
AGGTTTGGAAGAATTTGCCA
58
CTGGATTGCTATTTCCAGAAGAG
59
TTGCTTGCTGTACATGGAC
59
TATGAGGGCAGTTCTTCCA
58
AGGTTTGGAAGAATTTGCCA
58
TGGATTGCTATTTCCAGAAGAG
58
AGACTTAAAGCTGACATCAGAG
58
TCTTGAGTCACTTTCTCATGC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

POTEA基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

POTEA基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 POTEA基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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