PGC (progastricsin)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PGC
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
pepsinogen C
entrez id:
5225
ensembl gene id:
ENSG00000096088
ucsc gene id:
uc003ora.3
refseq accession:
NM_001166424
hgnc_id:
HGNC:8890
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PGC（Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma Coactivator）基因家族是一组重要的转录共激活因子，主要参与调控能量代谢、线粒体生物合成和氧化应激反应。PGC-1α（PPARGC1A）是该家族中最具代表性的成员，广泛表达于高能量需求的组织如骨骼肌、心脏、肝脏和棕色脂肪组织中。PGC-1α通过与其他转录因子（如PPARγ、NRF1/2）相互作用，激活线粒体功能相关基因的表达，促进脂肪酸氧化、葡萄糖代谢和产热作用。其功能特点包括响应环境刺激（如寒冷、运动）而上调，并参与适应性产热和胰岛素敏感性调节。若PGC-1α发生突变（如Gly482Ser多态性），可能导致线粒体功能缺陷，与2型糖尿病、肥胖和神经退行性疾病（如帕金森病）相关。过表达PGC-1α可增强线粒体数量和氧化能力，改善代谢疾病模型中的胰岛素抵抗，但过度激活可能引起肌肉纤维类型异常转化；而敲低或表达不足则会导致能量代谢紊乱、脂肪堆积和运动耐力下降。PGC家族还包括PGC-1β（PPARGC1B）和PRC（PGC-1-related coactivator），它们共享类似的结构域（如RNA结合模体和转录激活域），均参与代谢调控，但组织分布和下游靶基因存在差异。例如，PGC-1β更侧重脂代谢调控，而PRC主要在增殖细胞中起作用。该家族基因的共同特性是通过整合环境与激素信号（如肾上腺素、甲状腺激素）来协调代谢稳态，其表达异常与代谢综合征、心血管疾病和衰老密切相关。

This gene encodes an aspartic proteinase that belongs to the peptidase family A1. The encoded protein is a digestive enzyme that is produced in the stomach and constitutes a major component of the gastric mucosa. This protein is also secreted into the serum. This protein is synthesized as an inactive zymogen that includes a highly basic prosegment. This enzyme is converted into its active mature form at low pH by sequential cleavage of the prosegment that is carried out by the enzyme itself. Polymorphisms in this gene are associated with susceptibility to gastric cancers. Serum levels of this enzyme are used as a biomarker for certain gastric diseases including Helicobacter pylori related gastritis. Alternate splicing results in multiple transcript variants. A pseudogene of this gene is found on chromosome 1. [provided by RefSeq, Oct 2009]

这个基因编码的天冬氨酸蛋白酶属于肽酶家族A 1。所编码的蛋白质是在胃中产生并构成胃粘膜的主要成分的消化酶。这种蛋白也分泌到血清。这种蛋白质被合成为一个无活性的酶原，其中包括一个高碱性prosegment。这种酶是由被酶本身进行的prosegment的顺序裂解转化成其活性的成熟形式在低pH。这种基因多态性与易患胃癌有关。这种酶的血清水平被用作某些胃疾病，包括幽门螺旋杆菌有关的胃炎的生物标志物。选择性剪接结果在多个抄本变形。这种基因的一个假的1号染色体上[由RefSeq的，2009年10月提供]研究发现

OMIM数据库中对PGC基因的介绍     Wikipedia数据库中对PGC基因的介绍

基因序列

基因序列

PGC基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PGC基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1316979       rs2027524       rs2027525       rs2040017       rs2395785       rs3789210       rs3804279       rs3804280       rs4397220       rs4711690       rs4714509       rs4714510       rs4987196       rs5015774       rs5875768       rs6458237       rs6909468      

基因表达

基因表达

PGC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATTCAGAATCTGCCCAGC
59
TAGCCGTTGTTACTGAGGA
58
TCATCTGCAAGCAAAGAGTG
59
TACTTGTGGGTCCTCAGGA
60
TACATGGATGTCCAGAGCA
58
CATAGACGAAGTTGGTACCAG
58
CTACCTCAGCAACCTGGTC
60
CTTCTCTGGTAGCTGGAGTG
60
TATGACACCCTGACTGTCC
58
TAGACGAAGTTGGTACCAGG
59
GTCTACCTCAGCAACCTGG
60
CTCTGGTAGCTGGAGTGTG
60
TGGATAGCAGCCTGTACAC
59
GATGAGGAACTCTTCAATGCC
59
CTATGACACCCTGACTGTCC
60
AGACGAAGTTGGTACCAGG
59
ATCTGCAAGCAAAGAGTGC
59
ATACTTGTGGGTCCTCAGG
58
CTACATGGATGTCCAGAGCA
59
ATAGACGAAGTTGGTACCAGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PGC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PGC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004190
A2A3L9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
A2A3L9 (UniProtKB)
IEA
GO:0002803
P20142 (UniProtKB)
IMP
GO:0004190
P20142 (UniProtKB)
IMP
GO:0005615
P20142 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
P20142 (UniProtKB)
IEA
GO:0007586
P20142 (UniProtKB)
IEA
GO:0030163
P20142 (UniProtKB)
IBA
GO:0070062
P20142 (UniProtKB)
IDA
GO:0004190
Q4VXA6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q4VXA6 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PGC基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Neoplasms 0.013264433 5 0 GAD_LHGDN
Malignant neoplasm of stomach 0.009815515 11 6 BeFree_GAD
Gastritis, Atrophic 0.003995683 6 4 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.003800186 14 2 BeFree
Mammary Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Gastric ulcer 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
Malignant neoplasm of breast 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
melanoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Stomach Carcinoma 0.002714419 10 6 BeFree
Precancerous Conditions 0.002638474 1 0 BeFree_GAD

基因相关服务

基因相关服务

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