PCAT6 (prostate cancer associated transcript 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT6
locus group:
non-coding RNA
location:
1q32.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
ncRNA-a2|PCAN-R1|KDM5BAS1|onco-lncRNA-96
alias name:
prostate cancer-associated noncodi…
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100506696
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ENSG00000228288
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_046325
hgnc_id:
HGNC:43714
approved reserved:
2012-02-02

基因染色体位置

基因染色体位置

1q32.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCAT6（前列腺癌相关转录本6）是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于前列腺癌相关转录本（PCAT）基因家族。该家族成员主要在前列腺组织中高表达，并在前列腺癌的发生发展中起关键调控作用。PCAT6通过多种机制参与肿瘤进程，包括调控细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭。其主要作用位点在细胞核内，通过与转录因子或染色质修饰复合物相互作用，影响下游基因的表达。PCAT6的突变或异常表达可能导致其功能失调，进而促进肿瘤进展。研究表明，PCAT6的高表达与前列腺癌的恶性程度、转移风险和不良预后密切相关。此外，PCAT6还参与调控上皮-间质转化（EMT）过程，这是癌症转移的重要步骤。当PCAT6过表达时，会促进肿瘤细胞的增殖和转移能力，同时抑制凋亡；而降低PCAT6表达则能逆转这些效应，抑制肿瘤生长。PCAT6还与其他基因如EZH2（组蛋白甲基转移酶）和miRNAs（如miR-143）相互作用，形成复杂的调控网络。PCAT基因家族的共性在于它们多为lncRNA，在前列腺癌中异常表达，并通过表观遗传调控、信号通路干预等方式影响肿瘤生物学行为。PCAT6作为该家族的重要成员，其功能研究为前列腺癌的诊断和治疗提供了潜在靶点。

None

无

OMIM数据库中对PCAT6基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCAT6基因的介绍

基因序列

基因序列

PCAT6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2275891       rs2275892       rs2275893       rs2275894       rs2275895       rs4245713       rs6699000       rs12140749       rs74654674       rs76449900       rs77556400       rs111633511       rs114077339       rs116729297       rs117271214       rs137955287       rs138633428      

基因表达

基因表达

PCAT6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCCATCCAACTCCCAGAC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
CAAATATTTGTGGAGCGTGTG
59
GTCCATCCAACTCCCAGAC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
AATATTTGTGGAGCGTGTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
AGATGAGCTGAGATGGACTG
59
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
AGATGAGCTGAGATGGACTG
59
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
ATATTTGTGGAGCGTGTGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT6基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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