PCAT5 (prostate cancer associated transcript 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT5
locus group:
non-coding RNA
location:
10p11.21
gene_family:
alias symbol:
TPCAT-10-36067
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None
entrez id:
102578074
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ENSG00000280719
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None
refseq accession:
NR_110138
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HGNC:48665
approved reserved:
2013-12-06

基因染色体位置

基因染色体位置

10p11.21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCAT5（前列腺癌相关转录本5）是一种长链非编码RNA（lncRNA），最初在前列腺癌中被发现，属于一类与癌症发生发展密切相关的非编码RNA基因家族。PCAT5在多种癌症中表现出异常表达，尤其在激素依赖性癌症如前列腺癌中发挥重要作用。它的主要生物学功能包括调控细胞增殖、凋亡和侵袭转移，主要通过表观遗传调控或作为竞争性内源RNA（ceRNA）影响下游信号通路。PCAT5的作用位点集中在细胞核和细胞质，通过与特定蛋白质或miRNA相互作用来影响基因表达网络。当PCAT5发生突变或表达异常时，可能导致其调控功能紊乱，例如突变可能破坏其与结合蛋白的相互作用，进而影响癌症相关信号通路（如AR信号通路）的活性。PCAT5过表达通常与癌症恶性进展相关，如促进肿瘤细胞增殖、抑制凋亡和增强转移能力；而降低PCAT5表达则可能抑制这些表型。PCAT5属于lncRNA基因家族，该家族成员普遍具有组织特异性表达模式，并通过调控染色质重塑、转录或转录后过程影响疾病发生。研究表明PCAT5与前列腺癌、乳腺癌等疾病的诊断和预后相关，其表达水平可作为潜在的生物标志物。

None

无

OMIM数据库中对PCAT5基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCAT5基因的介绍

基因序列

基因序列

PCAT5基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs592057       rs765543       rs765544       rs765545       rs945492       rs945493       rs1336065       rs1832171       rs2384457       rs2484855       rs2784750       rs2804814       rs2804816       rs4614383       rs4934764       rs4934765       rs4934766      

基因表达

基因表达

PCAT5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATGTTACAACAGAGCTTGC
58
TAAATTGTTCCCACCGCTG
59
ATGTTACAACAGAGCTTGCT
58
TAAATTGTTCCCACCGCTG
59
ATGTTACAACAGAGCTTGCTG
59
TAAATTGTTCCCACCGCTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT5基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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