PCAT4 (prostate cancer associated transcript 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT4
locus group:
non-coding RNA
location:
4q21.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
GDEP|PCAN1|PCA4
alias name:
prostate cancer gene 1|gene differ…
entrez id:
118425
ensembl gene id:
ENSG00000251321
ucsc gene id:
None
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NR_026555
hgnc_id:
HGNC:24853
approved reserved:
2013-05-11

基因染色体位置

基因染色体位置

4q21.21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCAT4（前列腺癌相关转录本4）是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于前列腺癌相关转录本（PCAT）基因家族。该家族成员主要在前列腺组织中表达，并在前列腺癌的发生发展中发挥重要作用。PCAT4的生物学功能涉及调控细胞增殖、凋亡和侵袭等过程，其表达异常与前列腺癌的进展密切相关。PCAT4的主要作用位点包括染色质修饰复合物和转录调控网络，通过表观遗传学机制影响下游基因的表达。PCAT4的突变或表达失调可能导致其功能异常，进而促进肿瘤细胞的恶性转化和转移。研究表明，PCAT4在前列腺癌中常呈现过表达，其高表达与肿瘤的侵袭性增强、预后不良相关。PCAT4过表达可能通过激活致癌信号通路（如Wnt/β-catenin或PI3K/AKT通路）或抑制抑癌基因（如PTEN）来促进肿瘤发展。相反，降低PCAT4表达可能抑制肿瘤细胞的增殖和转移能力，提示其作为潜在治疗靶点的价值。PCAT基因家族的共性在于它们均为lncRNA，在前列腺癌中异常表达，并通过调控基因表达网络参与肿瘤发生。该家族成员通常具有组织特异性，并在肿瘤微环境中发挥复杂作用。PCAT4与其他PCAT成员可能协同或拮抗地调节前列腺癌的生物学行为。此外，PCAT4的表达可能受到雄激素受体信号通路的调控，这与其在前列腺癌中的重要作用一致。除前列腺癌外，PCAT4的异常表达还可能与其他癌症类型相关，但其具体机制仍需进一步研究。

None

无

OMIM数据库中对PCAT4基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCAT4基因的介绍

基因序列

基因序列

PCAT4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1132460       rs1132461       rs3223216       rs3898227       rs4234852       rs4271959       rs4309779       rs4312704       rs4358337       rs4371563       rs4393949       rs4434187       rs4441708       rs4444770       rs4463018       rs4470573       rs4472087      

基因表达

基因表达

PCAT4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGGGTCACTGAAATGGGA
58
ATGTTGCAAATGACATGGTC
57
AGGGTCACTGAAATGGGAC
59
GTTAGTATGTGTAGGATTCAAGCAG
59
AGGGTCACTGAAATGGGAC
59
ATGTTGCAAATGACATGGTC
57
AAAGGGTCACTGAAATGGG
57
AGTATGTGTAGGATTCAAGCAG
58
GTGAGGAACTGAGAAACATGG
59
GTCCCATTTCAGTGACCCT
59
AAGGGTCACTGAAATGGGA
58
AGTATGTGTAGGATTCAAGCAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT4基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.001085767 4 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Prostatic Neoplasms 0.000814326 3 0 BeFree
Ataxia Telangiectasia 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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