PCAT19 (prostate cancer associated transcript 19)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT19
locus group:
non-coding RNA
location:
19q13.2
gene_family:
alias symbol:
LINC01190
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
100505495
ensembl gene id:
ENSG00000267107
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None
refseq accession:
NR_040109
hgnc_id:
HGNC:49593
approved reserved:
2014-01-20

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCAT19（前列腺癌相关转录本19）是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于前列腺癌相关转录本基因家族（PCAT家族），该家族成员主要在前列腺组织中特异性表达，并在前列腺癌的发生发展中发挥重要作用。PCAT19的生物学功能主要涉及调控基因表达、细胞增殖和肿瘤进展，其表达产物通过表观遗传修饰或与蛋白质相互作用影响下游信号通路。PCAT19的主要作用位点包括细胞核和细胞质，在核内可能参与染色质重塑或转录调控，而在胞质中可能影响mRNA稳定性或翻译效率。突变或异常表达可能导致PCAT19功能失调，例如某些单核苷酸多态性（SNP）可能改变其二级结构或结合能力，从而影响其调控作用，与前列腺癌的侵袭性、转移风险或耐药性相关。研究表明，PCAT19过表达可能促进肿瘤细胞增殖、抑制凋亡，并通过激活Wnt/β-catenin或PI3K/AKT等通路加速癌症进展；而降低其表达可能抑制肿瘤生长或增强化疗敏感性。此外，PCAT19可能与其他基因（如AR、MYC）相互作用，共同调控前列腺癌的转录网络。PCAT家族成员的共性包括组织特异性高表达、参与肿瘤相关通路调控，以及作为生物标志物或治疗靶点的潜力。目前，PCAT19的深入研究仍在进行中，其在前列腺癌诊断和治疗中的应用前景值得关注。

None

无

OMIM数据库中对PCAT19基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCAT19基因的介绍

基因序列

基因序列

PCAT19基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT19基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs758643       rs887391       rs887392       rs1005643       rs1962625       rs1962626       rs1987757       rs2005832       rs2079809       rs2079810       rs2079811       rs2098106       rs2098107       rs2109233       rs2191139       rs2316974       rs4802119      

基因表达

基因表达

PCAT19基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCAGAACAGGGAGGAAGAG
59
AGCTCAGGAGAACAGTGTC
59
TCAGAACAGGATGGCAGAG
59
TCCATGAAACAGATGACTGGA
59
GGAGTGAGGTCTCATGTCTG
60
ATCTAGCTAGGCCTGTTCTG
59
TGTTTCATGGAATTCACCAGTC
59
TATCTCCAATGGTTCCTTCCTG
60
ACTCTGTTAGAAGAAGCATCAG
58
CAATGGTTCAGGGAGAAAGG
59
CCAATGACATCCAATGGAGG
59
TCCTGGTGGTTGTTTAATCAC
59
CAGAACAGGGAACCATTGG
59
CCAAGAAGATTCTTATCAGCTCC
59
AGAACAGGATGGAGTCTTGC
60
CCTTCAAAGAGTAATGAGTATCTCC
59
CAATGACATCCAATGGAGGA
58
TCCTGGTGGTTGTTTAATCAC
59
TGGAGTGAGGTCTCATGTC
58
TCTAGCTAGGCCTGTTCTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT19基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT19基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT19基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.12 1 1 GWASCAT

基因相关服务

基因相关服务

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