PCAT1 (prostate cancer associated transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT1
locus group:
non-coding RNA
location:
8q24.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
PCAT-1|PCA1|PiHL
alias name:
p53 inhibiting lncRNA
entrez id:
100750225
ensembl gene id:
ENSG00000253438
ucsc gene id:
uc064qdc.1
refseq accession:
NR_045262
hgnc_id:
HGNC:43022
approved reserved:
2011-10-04

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCAT1（前列腺癌相关转录本1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），最初在前列腺癌中被发现，属于非编码RNA家族。PCAT1在多种癌症中异常表达，尤其在前列腺癌中显著上调，与肿瘤的发生、发展和转移密切相关。PCAT1的主要生物学功能包括调控细胞增殖、凋亡、侵袭和转移，其作用机制涉及与多种蛋白质和miRNA的相互作用，从而影响关键信号通路，如Wnt/β-catenin、PI3K/AKT和EMT（上皮-间质转化）通路。PCAT1的过表达会促进肿瘤细胞的恶性行为，而降低其表达则可能抑制肿瘤生长和转移。PCAT1的突变或异常表达与前列腺癌、乳腺癌、结直肠癌等多种癌症的预后不良相关，可能作为潜在的诊断标志物或治疗靶点。PCAT1属于lncRNA家族，这一家族的成员通常不编码蛋白质，但通过调控基因表达、染色质修饰和信号通路在多种生理和病理过程中发挥重要作用。PCAT1的异常表达还可能影响其他基因的功能，例如通过竞争性结合miRNA（ceRNA机制）来解除对靶基因的抑制，从而促进肿瘤进展。研究PCAT1的功能和机制有助于深入理解癌症的发生发展，并为开发新的治疗策略提供线索。

None

无

OMIM数据库中对PCAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

PCAT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs710885       rs710886       rs785002       rs785003       rs785004       rs785005       rs785006       rs814165       rs1026411       rs1031585       rs1551513       rs1551514       rs1551515       rs1902432       rs2015595       rs2124597       rs2606181      

基因表达

基因表达

PCAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCAGCCAGATGAAATGCT
57
TGAGGTGATTCTTAGAGTCCT
58
CGCAGATACATAAGACCATGG
59
CTCCGCTGCTTTATAACCC
58
GCAGATACATAAGACCATGGA
57
TCTCCGCTGCTTTATAACC
57
AGCCAGATGAAATGCTATGTG
59
TATGAGGTGATTCTTAGAGTCCTC
59
CGCAGATACATAAGACCATGG
59
TCCGCTGCTTTATAACCCA
59
ATCAGCCAGATGAAATGCT
57
GAGGTGATTCTTAGAGTCCTC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.002714419 10 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Multiple Myeloma 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Anemia 0.000271442 1 0 BeFree
Benign Prostatic Hyperplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Prostatic Intraepithelial Neoplasias 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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