PAX7 (paired box 7)

symbol:
PAX7
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.13
gene_family:
PRD class homeoboxes and pseudogenes|Paired boxes
alias symbol:
Hup1
alias name:
None
entrez id:
5081
ensembl gene id:
ENSG00000009709
ucsc gene id:
uc010oct.3
refseq accession:
NM_002584
hgnc_id:
HGNC:8621
approved reserved:
1992-11-20
1p36.13
基因染色体位置图

PAX7是PAX基因家族中的一员,属于配对盒(PAX)转录因子家族,该家族共有9个成员(PAX1-PAX9),其共同特点是含有一个高度保守的DNA结合结构域——配对盒结构域,能够调控靶基因的表达,在胚胎发育、细胞分化和组织稳态中发挥关键作用。PAX7主要在骨骼肌卫星细胞中高表达,是肌肉干细胞(卫星细胞)维持自我更新和未分化状态的核心调控因子,其表达产物通过激活下游靶基因(如Myf5)促进肌肉再生和修复。PAX7的功能特点包括维持干细胞库的稳定性、抑制过早分化,并在肌肉损伤后激活卫星细胞增殖。若PAX7发生功能丧失性突变,会导致卫星细胞数量减少或功能缺陷,引发先天性肌病或肌肉再生障碍;而染色体易位导致的PAX7过表达与儿童横纹肌肉瘤(一种肌肉组织恶性肿瘤)密切相关。PAX7表达水平异常(过高或过低)均会破坏肌肉稳态:过表达可能促使卫星细胞异常增殖和癌变,同时抑制肌细胞终末分化;而表达不足则导致肌肉再生能力下降,加速肌萎缩。PAX7还与神经嵴细胞发育相关,其突变可能影响黑色素细胞和部分神经元的形成。在基因家族中,PAX成员均参与器官形成(如PAX6调控眼睛发育),但PAX7的特异性在于其专一性调控肌肉干细胞命运,这种功能分工使PAX家族成为发育生物学和再生医学的重要研究对象。

This gene is a member of the paired box (PAX) family of transcription factors. Members of this gene family typically contain a paired box domain, an octapeptide, and a paired-type homeodomain. These genes play critical roles during fetal development and cancer growth. The specific function of the paired box 7 gene is unknown but speculated to involve tumor suppression since fusion of this gene with a forkhead domain family member has been associated with alveolar rhabdomyosarcoma. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2008]

此基因是配对盒(PAX)家族的转录因子的成员。此基因家族成员通常包含配对盒结构域,八肽,以及一个成对型同源异型域。这些基因发挥胎儿的发育和肿瘤生长过程中的关键作用。配对盒7基因的具体功能不明,但推测由于这个基因与叉头域家族成员的融合已经与腺泡型横纹肌肉瘤相关的涉及抑制肿瘤。已发现该基因编码不同亚型三个抄本变形。 [由RefSeq的,2008年9月提供]

PAX7基因的碱基序列:[NCBI]
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PAX7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs84353       rs480856       rs485874       rs501080       rs515124       rs515739       rs518459       rs523997       rs524568       rs526265       rs545044       rs545793       rs551027       rs553934       rs556630       rs568991       rs570242      

PAX7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGTTCAGCTGGGAGATCC
59
CGGCTAATCGAACTCACTG
58
GACTCCATCAAGCCAGGAG
60
GATAATCAACAGCAGTCTGGC
60
TGCCCTCAGGTTTAGTGAG
59
TCTTGTCCGCTTCATCCTC
60
CTACCCAGACATATACACCCG
60
TTACTGAACCAGACCTGCA
59
ATGTTCAGCTGGGAGATCC
59
AACTCACTAAACCTGAGGGC
60
CTCCATCAAGCCAGGAGAC
60
CAGATAATCAACAGCAGTCTGG
59
TACCCAGACATATACACCCG
58
GTTACTGAACCAGACCTGC
58
ATGTTCAGCTGGGAGATCC
59
TAATCGAACTCACTGAGGGC
60
CTCCATCAAGCCAGGAGAC
60
GATAATCAACAGCAGTCTGGC
60
ACTACCCAGACATATACACCC
59
TACTGAACCAGACCTGCAC
59
      尚未收录相关数据

PAX7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PAX7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000983
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
P23759 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0006338
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0009653
P23759 (UniProtKB)
TAS
GO:0010453
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0014813
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0021527
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0021904
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0031062
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
P23759 (UniProtKB)
TAS
GO:0043393
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0043403
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0048663
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0048706
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0051216
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:0060415
P23759 (UniProtKB)
IEA
GO:2000288
P23759 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PAX7基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alveolar rhabdomyosarcoma 0.255220608 37 0 BeFree_CTD_human_LHGDN_ORPHANET
Rhabdomyosarcoma 0.01114898 22 0 BeFree_LHGDN
Rhabdomyosarcoma, Embryonal 0.009801702 8 0 BeFree_LHGDN
Narcolepsy 0.002367032 1 0 GAD
Cleft Palate 0.002367032 1 0 GAD
Cleft Lip 0.002367032 1 0 GAD
Parkinson Disease 0.002367032 1 1 GAD
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Myopathy 0.000542884 2 0 BeFree
Cleft Lip with or without Cleft Palate 0.000542884 2 0 BeFree

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