PAX1 (paired box 1)

symbol:
PAX1
locus group:
protein-coding gene
location:
20p11.22
gene_family:
Paired boxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
5075
ensembl gene id:
ENSG00000125813
ucsc gene id:
uc002wsj.4
refseq accession:
NM_001257096
hgnc_id:
HGNC:8615
approved reserved:
1992-05-11
20p11.22
基因染色体位置图

PAX1(Paired Box 1)基因属于PAX基因家族,该家族由9个成员(PAX1-PAX9)组成,编码的蛋白质均含有保守的配对盒(paired box)结构域,能够结合DNA并调控靶基因的转录,在胚胎发育、细胞分化和组织形成中发挥关键作用。PAX1主要在胚胎发育过程中表达,尤其在体节、脊椎、胸腺和甲状旁腺的形成中起重要作用。它通过调控间充质细胞的增殖和分化参与骨骼系统的模式形成,特别是脊椎和肋骨的发育。PAX1蛋白作为转录因子,通过与其他蛋白质(如SOX9)相互作用激活或抑制下游靶基因的表达。PAX1基因突变可能导致其功能丧失,与多种先天性畸形相关,如脊椎肋骨发育不全综合征(spondylocostal dysostosis),表现为脊椎和肋骨严重畸形。此外,PAX1表达异常(如甲基化导致的沉默)与某些癌症(如甲状腺癌和胸腺瘤)的发生发展有关。PAX1过表达可能促进某些间充质来源肿瘤的进展,而降低表达则可能导致骨骼发育异常或免疫器官(如胸腺)发育缺陷。PAX1与家族其他成员(如PAX3、PAX7)共享配对盒结构域,但各成员在表达模式和功能上存在组织特异性差异。研究PAX1有助于理解先天性骨骼疾病和肿瘤的分子机制,并为相关疾病的诊断和治疗提供潜在靶点。

This gene is a member of the paired box (PAX) family of transcription factors. Members of the PAX family typically contain a paired box domain and a paired-type homeodomain. These genes play critical roles during fetal development. This gene plays a role in pattern formation during embryogenesis and may be essential for development of the vertebral column. This gene is silenced by methylation in ovarian and cervical cancers and may be a tumor suppressor gene. Mutations in this gene are also associated with vertebral malformations. [provided by RefSeq, Mar 2012]

此基因是配对盒(PAX)家族的转录因子的成员。在PAX家族的成员通常包含一个配对盒域和配对型同源。这些基因胚胎发育过程中发挥关键作用。这个基因起着胚胎发生期间在图案形成作用并可以是用于脊柱的发展是至关重要的。此基因是通过在卵巢癌和子宫颈癌甲基化沉默,可能是一种肿瘤抑制基因。在这个基因的突变也与脊椎畸形。 [由RefSeq的,2012年3月提供]

PAX1基因的碱基序列:[NCBI]
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PAX1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6035933       rs17861025       rs17861026       rs17861027       rs17861028       rs77349642       rs112861716       rs114733842       rs115768690       rs116432825       rs139255769       rs140069026       rs142366988       rs144838347       rs149419041       rs182423023       rs182650465      

PAX1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCCCTCTATGCCTCTCAC
59
ATACGTCTGCTCCATAGCG
60
AATACACTCAGTCGGCCTC
59
CTTGAAGGTCATTGCTGCC
59
CCCAAGATGGAAGACTGGG
60
CCGACTGAGTGTATTTAATGTCTG
60
AAACCTGCCTTAGAGGCAG
60
TTCCTGTCAGCCACTTCTC
59
TCGGATGAAGTTCACCCTG
59
GTAGATGTGGTTGTAGGGC
58
CTCCCTCTATGCCTCTCAC
59
ATACGTCTGCTCCATAGCG
60
CCCAAGATGGAAGACTGGG
59
CCGACTGAGTGTATTTAATGTCTG
59
ATCGGATGAAGTTCACCCT
58
TAGATGTGGTTGTAGGGCAG
59
TCCCAAGATGGAAGACTGG
59
GACTGAGTGTATTTAATGTCTGCC
60
CCTTAGAGGCAGACATTAAATACAC
60
TTCCTGTCAGCCACTTCTC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
PAX1
PDGFRA
Unknown

PAX1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PAX1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A0A087WXV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
A0A087WXV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A087WXV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
A0A087WXV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A087WXV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
A0A087WXV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0001501
P15863 (UniProtKB)
TAS
GO:0001756
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0006366
P15863 (UniProtKB)
TAS
GO:0008283
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0043367
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0043374
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0048538
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0060017
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0060349
P15863 (UniProtKB)
IEA
GO:0061056
P15863 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PAX1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
OTOFACIOCERVICAL SYNDROME 2 0.24 1 1 CLINVAR_UNIPROT
Fara Chlupackova syndrome 0.12 0 0 ORPHANET
Androgenetic Alopecia 0.004734064 2 2 GAD
Scoliosis, unspecified 0.002367032 1 0 GAD
Cervix carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
High-Grade Squamous Intraepithelial Lesions 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant tumor of cervix 0.001085767 4 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000814326 3 0 BeFree
Jarcho-Levin syndrome 0.000542884 2 0 BeFree
Spina Bifida 0.000542884 2 0 BeFree

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