ODF4 (outer dense fiber of sperm tails 4)

symbol:
ODF4
locus group:
protein-coding gene
location:
17p13.1
gene_family:
alias symbol:
OPPO1|CT136
alias name:
cancer/testis antigen 136
entrez id:
146852
ensembl gene id:
ENSG00000184650
ucsc gene id:
uc002gle.2
refseq accession:
NM_001319953
hgnc_id:
HGNC:19056
approved reserved:
2002-12-09
17p13.1
基因染色体位置图

ODF4(Outer Dense Fiber Protein 4)是一种主要存在于精子尾部外致密纤维中的结构蛋白,属于外致密纤维蛋白家族(ODF family)。该家族成员在精子形态发生和运动功能中起关键作用,其共性包括形成精子尾部骨架结构、维持鞭毛稳定性以及参与精子运动能力的调节。ODF4通过与微管蛋白和其他纤维蛋白相互作用,帮助构建精子尾部的刚性结构,确保精子鞭毛的机械强度和摆动效率。该基因的表达具有睾丸特异性,尤其在精子发生后期阶段活跃。ODF4功能异常或突变可能导致精子尾部结构缺陷,表现为精子运动力减弱(弱精症)或形态异常(畸形精子症),严重时可引发男性不育。研究发现,ODF4基因敲除小鼠的精子表现出鞭毛弯曲和运动障碍,证实其对精子功能的必要性。过表达ODF4虽罕见,但可能干扰其他纤维蛋白的组装平衡,影响精子尾部结构的精细调控;而表达降低则直接导致外致密纤维发育不全。此外,ODF家族基因(如ODF1-3)的突变常与人类不育症相关,提示该家族在生殖健康中的重要性。目前尚未发现ODF4与癌症或其他系统疾病的直接关联,其研究主要集中在男性生殖领域。针对该基因的检测可能为特发性不育症提供分子诊断依据,但尚未开发出针对性的基因治疗方法。

This gene encodes a protein that is localized in the outer dense fibers of the tails of mature sperm. This protein is thought to have some important role in the sperm tail. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码在成熟精子的尾部外致密纤维本地化的蛋白质。这种蛋白质被认为有在精子尾部一些重要的作用。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ODF4基因的碱基序列:[NCBI]
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ODF4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs918274       rs2008274       rs2302869       rs4791531       rs4792329       rs4792334       rs6503102       rs6503103       rs7213495       rs7213527       rs7218192       rs7219472       rs8067999       rs8069158       rs8069620       rs8070734       rs8074854      

ODF4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTAGAGAATGGGAAAGTCACC
57
CCTTTCCAACTCGAAGATCC
58
AGAAAGAGACCAACATCAGAG
57
GGAGAAGATGAAGGTGACTG
57
GAGAAAGAGACCAACATCAGAG
58
GAGAAGATGAAGGTGACTGTG
58
TTAGAGAATGGGAAAGTCACCT
58
CCTTTCCAACTCGAAGATCC
58
GGAGAAAGAGACCAACATCAG
58
GAAGATGAAGGTGACTGTGC
59
ACTTAGAGAATGGGAAAGTCAC
57
TTTCCAACTCGAAGATCCAG
57
      尚未收录相关数据

ODF4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ODF4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C3TX97 (UniProtKB)
IEA
GO:0001520
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ODF4基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Experimental Organism Basal Cell Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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