ODF2 (outer dense fiber of sperm tails 2)

symbol:
ODF2
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.11
gene_family:
alias symbol:
ODF84|CT134
alias name:
cancer/testis antigen 134|cenexin
entrez id:
4957
ensembl gene id:
ENSG00000136811
ucsc gene id:
uc064wes.1
refseq accession:
NM_001242352
hgnc_id:
HGNC:8114
approved reserved:
1998-07-03
9q34.11
基因染色体位置图

ODF2(Outer Dense Fiber of Sperm Tails 2)是一种主要存在于精子尾部外致密纤维中的结构蛋白,属于ODF基因家族。该基因家族成员(如ODF1、ODF2等)的共同特点是编码精子尾部结构的核心组分,负责维持精子鞭毛的机械强度和运动功能。ODF2蛋白在精子发生过程中高度表达,其核心功能是参与形成精子尾部"9+2"微管结构的外周致密纤维,这些纤维像脚手架一样包裹轴丝,为精子游动提供结构支撑和弹性回弹力。研究发现ODF2通过其卷曲螺旋结构域与多种鞭毛相关蛋白(如SPAG4、SPAG5)相互作用,共同维持鞭毛结构的完整性。当ODF2发生突变时,会导致精子尾部畸形(如短尾、卷尾等)和运动障碍,这是男性不育症的重要病因之一,约占弱精症病例的15%。在小鼠模型中,ODF2基因敲除会导致精子完全丧失运动能力。值得注意的是,ODF2在体细胞中也存在低水平表达,最新研究揭示其参与中心粒稳定性维持和有丝分裂调控,过表达可能引起非整倍体等染色体异常,与某些癌症(如肝癌、乳腺癌)的发生发展相关。而表达量不足时,除影响精子发生外,还可能干扰纤毛上皮细胞(如呼吸道纤毛)的正常功能,导致纤毛运动障碍综合征。该基因的转录受睾丸特异性启动子和CREM转录因子调控,其表达水平可作为男性生殖功能的分子标志物。

The outer dense fibers are cytoskeletal structures that surround the axoneme in the middle piece and principal piece of the sperm tail. The fibers function in maintaining the elastic structure and recoil of the sperm tail as well as in protecting the tail from shear forces during epididymal transport and ejaculation. Defects in the outer dense fibers lead to abnormal sperm morphology and infertility. This gene encodes one of the major outer dense fiber proteins. Alternative splicing results in multiple transcript variants. The longer transcripts, also known as 'Cenexins', encode proteins with a C-terminal extension that are differentially targeted to somatic centrioles and thought to be crucial for the formation of microtubule organizing centers. [provided by RefSeq, Oct 2010]

外致密纤维包围在中间片和精子尾部的主段轴丝骨架结构。该纤维的功能在维持精子尾部的弹性结构和反冲以及在附睾运输和射精期间保护从剪切力的尾巴。在外部密集纤维缺陷导致精子形态异常和不育。该基因编码的主要外致密的纤维蛋白之一。选择性剪接结果在多个抄本变形。较长的转录物,也被称为‘Cenexins‘,编码的蛋白质具有C-末端延伸被差分定位到体中心粒并认为是微管组织中心的形成至关重要。 [由RefSeq的,2010年10月提供]

ODF2基因的碱基序列:[NCBI]
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ODF2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1133750       rs3088209       rs3192738       rs3814529       rs3924786       rs4075146       rs4128171       rs4240429       rs4268218       rs4308838       rs4363294       rs4512487       rs4617262       rs4621923       rs4836613       rs4837267       rs4837268      

ODF2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACAGGTGATTGCCAAGAGG
60
CTTGGTTTGTTCCACCTGC
60
GTTCACGTGGATGAGAACAC
59
GTGAGATTTCTGGCTGCTG
59
GATGATGACTCAGGTCACTG
58
TTGCATCTTGACCTCAGAC
58
ACGGAGTAACGAGTCTCAC
59
TCGCTTGTGAGATTTCGTC
58
ATGCAAGTGGGAGAATCCA
59
CTTAACCGCATCACTGAGAC
59
GAAGGAAGAGCTGGAGGAG
59
TTCTGAAGTATGGTGAAGTCCT
59
GAAGATGATGACTCAGGTCAC
58
CATCTTGACCTCAGACTTCAG
58
TCACGTGGATGAGAACACC
60
TGTGAGATTTCTGGCTGCT
59
GAGTAACGAGTCTCACGCA
60
CTCGCTTGTGAGATTTCGTC
59
AGACTGAGCACGAGAACAC
60
GTAGGTGTTTCTTCTGAAGTATGG
59
      尚未收录相关数据

ODF2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ODF2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000086
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0000922
Q5BJF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0001520
Q5BJF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q5BJF6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005814
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005814
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
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TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
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Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
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TAS
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Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q5BJF6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
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TAS
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Q5BJF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q5BJF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007286
Q5BJF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0017137
Q5BJF6 (UniProtKB)
IPI
GO:0036064
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA
GO:0072372
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA
GO:0097539
Q5BJF6 (UniProtKB)
IEA
GO:1902017
Q5BJF6 (UniProtKB)
IMP
GO:0072372
Q5BJF6 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ODF2基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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