NUDT10 (nudix hydrolase 10)

symbol:
NUDT10
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.22
gene_family:
Nudix type motif-containing
alias symbol:
DIPP3a|hDIPP3alpha
alias name:
None
entrez id:
170685
ensembl gene id:
ENSG00000122824
ucsc gene id:
uc004dph.3
refseq accession:
NM_153183
hgnc_id:
HGNC:17621
approved reserved:
2002-02-13
Xp11.22
基因染色体位置图

NUDT10属于NUDIX水解酶基因家族,该家族成员通常具有保守的NUDIX结构域,能够水解核苷酸衍生物,参与细胞代谢调控、信号转导和氧化应激防御等过程。NUDT10编码的蛋白是一种二磷酸核苷水解酶,主要功能是水解8-oxo-dGTP和8-oxo-GTP等氧化损伤的核苷酸,防止这些异常核苷酸掺入DNA或RNA,从而维持基因组稳定性并减少氧化应激引起的突变。NUDT10在细胞核和线粒体中均有表达,其作用位点集中在核酸代谢活跃的区域。若NUDT10发生功能丧失性突变,会导致氧化损伤核苷酸积累,增加DNA突变率,与癌症、神经退行性疾病和衰老相关疾病的发生风险上升有关。当NUDT10过表达时,可增强细胞对氧化应激的抵抗能力,但可能干扰正常的核苷酸代谢平衡;而表达降低时则会使细胞更容易受到氧化损伤,加速基因组不稳定性。NUDT10与同家族的NUDT1(MTH1)功能相似,但底物特异性略有不同。NUDIX家族基因的共性在于它们都含有保守的NUDIX盒序列(GX5EX7REUXEEXGU,其中U代表疏水氨基酸),能够水解多种核苷酸衍生物,在调控细胞代谢和维持氧化还原平衡中起重要作用。研究表明NUDT10在某些癌症组织中表达异常,可能成为氧化应激相关疾病的潜在生物标志物或治疗靶点。

This gene is a member of the nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif containing family. The encoded protein is a phosphohydrolase and may regulate the turnover of diphosphoinositol polyphosphates. The turnover of these high-energy diphosphoinositol polyphosphates represents a molecular switching activity with important regulatory consequences. Molecular switching by diphosphoinositol polyphosphates may contribute to the regulation of intracellular trafficking. In some populations putative prostate cancer susceptibility alleles have been identified for this gene. Alternatively spliced transcript variants, which differ only in the 5' UTR, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2015]

该基因是包含家族的Nudix结构(核苷二磷酸联X部分)型基序的一个成员。编码的蛋白是一种磷酸水解,并可以调节diphosphoinositol聚磷酸盐的营业额。这些高能量diphosphoinositol聚磷酸盐的营业额代表了重要的调控后果的分子开关活动。通过diphosphoinositol聚磷酸盐分子开关可能会导致细胞内运输的监管。在某些人群推定前列腺癌易患性等位基因已经确定该基因。可变剪接转录物变体,其差异仅在5‘端非编码区,已发现了该基因。 [由RefSeq的,2015年2月提供]

NUDT10基因的碱基序列:[NCBI]
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NUDT10基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782807214       rs782806500       rs782798140       rs782795702       rs782795388       rs782787815       rs782779893       rs782778419       rs782765161       rs782764636       rs782741808       rs782736830       rs782715446       rs782708463       rs782704143       rs782701571       rs782701525      

NUDT10基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAGAAACTAAAGCTGGGC
58
TGCCATTCACTAGGGATCG
59
GAGAAACTAAAGCTGGGCG
58
ATGCCATTCACTAGGGATCG
59
GAGAAACTAAAGCTGGGCG
58
TGCCATTCACTAGGGATCG
59
      尚未收录相关数据

NUDT10基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NUDT10基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q8NFP7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8NFP7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8NFP7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005829
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0008486
Q8NFP7 (UniProtKB)
ISS
GO:0043647
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0046872
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0052840
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0052841
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0052841
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0052842
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0052842
Q8NFP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0052843
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0052844
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0052845
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0052846
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0052847
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0052848
Q8NFP7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 NUDT10基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.007101096 3 2 GAD
Polyendocrinopathies, Autoimmune 0.001628651 6 1 BeFree
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.001357209 5 0 BeFree
Autoimmune thyroid disease 0.000814326 3 0 BeFree
Polyglandular Type I Autoimmune Syndrome 0.000814326 3 0 BeFree
Thyroiditis 0.000542884 2 0 BeFree
Autoimmune Diseases 0.000542884 2 0 BeFree
Autoimmune Primary Adrenal Insufficiency 0.000271442 1 0 BeFree
Addison's disease due to autoimmunity 0.000271442 1 0 BeFree
Vitiligo 0.000271442 1 0 BeFree

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