NLRP4 (NLR family pyrin domain containing 4)

symbol:
NLRP4
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.43
gene_family:
NLR family
alias symbol:
PYPAF4|FLJ32126|PAN2|RNH2|CLR19.5|CT58
alias name:
nucleotide-binding oligomerization…
entrez id:
147945
ensembl gene id:
ENSG00000160505
ucsc gene id:
uc002qmd.5
refseq accession:
NM_134444
hgnc_id:
HGNC:22943
approved reserved:
2003-10-28
19q13.43
基因染色体位置图

NLRP4(NOD-like receptor family pyrin domain containing 4)属于NLR(NOD样受体)基因家族,该家族是一类模式识别受体(PRR),主要参与先天免疫反应,特别是炎症小体(inflammasome)的组装和调控。NLR家族成员通常包含三个结构域:中央的NOD(核苷酸结合寡聚化结构域)、C端的LRR(富含亮氨酸重复序列)和N端的效应结构域(如PYD或CARD),这些结构域使其能够感知病原体相关分子模式(PAMP)或危险相关分子模式(DAMP),并触发免疫信号通路。NLRP4在免疫调节中发挥重要作用,尤其在抑制过度炎症反应方面。它通过负向调控I型干扰素(IFN-I)信号通路和NF-κB通路来维持免疫稳态。NLRP4还能与E3泛素连接酶DTX4相互作用,促进TBK1的泛素化和降解,从而抑制干扰素调节因子3(IRF3)的激活,减少IFN-β的产生。此外,NLRP4可能通过抑制NLRP3炎症小体的活化来减轻炎症反应。NLRP4的突变或表达异常可能导致免疫失调。例如,NLRP4功能丧失可能解除对TBK1-IRF3通路的抑制,导致IFN-I过度产生,与自身免疫性疾病(如系统性红斑狼疮)相关。相反,NLRP4过表达可能过度抑制炎症反应,增加感染风险或削弱抗肿瘤免疫。研究还发现NLRP4在某些癌症中异常表达,可能通过调节细胞凋亡或免疫逃逸影响肿瘤进展。NLRP4在生殖系统中也有表达,可能参与精子发生或卵母细胞成熟的调控。NLRP4与其他NLR家族成员(如NLRP3、NLRC4)功能既有重叠又有差异,共同构成复杂的免疫调控网络。该基因的组织特异性表达和多重调控机制仍在深入研究,其作为潜在治疗靶点在自身免疫病、感染和癌症中的价值值得关注。

NALPs are cytoplasmic proteins that form a subfamily within the larger CATERPILLER protein family. Most short NALPs, such as NALP4, have an N-terminal pyrin (MEFV; MIM 608107) domain (PYD), followed by a NACHT domain, a NACHT-associated domain (NAD), and a C-terminal leucine-rich repeat (LRR) region. The long NALP, NALP1 (MIM 606636), also has a C-terminal extension containing a function to find domain (FIIND) and a caspase recruitment domain (CARD). NALPs are implicated in the activation of proinflammatory caspases (e.g., CASP1; MIM 147678) via their involvement in multiprotein complexes called inflammasomes (Tschopp et al., 2003 [PubMed 12563287]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

NALPs是形成较大的CATERPILLER蛋白家族中的一个亚家族胞质蛋白。最短NALPs,如NALP4,具有一个N-末端pyrin(MEFV; MIM 608107)结构域(PYD),随后是NACHT结构域,NACHT-相关联的域(NAD),和一个C末端富含亮氨酸的重复序列( LRR)区域。长NALP,NALP1(MIM 606636),还具有包含函数查找域(FIIND)和胱天蛋白酶募集结构域(CARD)的C-末端延伸。 NALPs有牵连的促炎半胱天冬的活化(例如,CASP1; MIM 147678)。通过其参与在多蛋白复合物称为inflammasomes(Tschopp等,2003 [搜索PubMed 12563287])[由OMIM,2008年3月提供的]

NLRP4基因的碱基序列:[NCBI]
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NLRP4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs177352       rs215216       rs302467       rs302468       rs302469       rs302470       rs302471       rs364696       rs382682       rs385329       rs394775       rs430218       rs430219       rs433389       rs8103392       rs8107667       rs8109389      

NLRP4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCCTGGTATACCTGATGTTGG
59
TGTTACGCAGAAGCATTTCAG
60
GAGAACAGGATACACAAAGACC
59
TCTCAGTGACAGACTTGCT
58
CTCTCGTGATGACATCAGGT
59
CAATTTACCAGCGCTAGCTC
60
CTGGATTCACTGTGTTTGGT
58
TTGATTGCTGATGAGAGCAG
58
GTCAAAGAGCTAGCGTTGG
59
GAGGTCTAGATAGCGCACG
60
GTCAAAGAGCTAGCGTTGG
59
GCTCTTGTTACGCAGAAGC
60
GAGAACAGGATACACAAAGACC
59
CTCAGTGACAGACTTGCTG
58
TCCTGGTATACCTGATGTTGG
59
TGTTACGCAGAAGCATTTCAG
60
GTATACCTGATGTTGGCTTTCTG
60
GCTCTTGTTACGCAGAAGC
60
CTTAGAGATTCTTGGGTTGGA
57
TTACTGCAGGTGAGAACAG
57
      尚未收录相关数据

NLRP4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NLRP4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
Q96MN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
Q96MN2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q96MN2 (UniProtKB)
TAS
GO:0006954
Q96MN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0032479
Q96MN2 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q96MN2 (UniProtKB)
IDA

可能调控 NLRP4基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Crohn Disease 0.002367032 1 0 GAD
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.002367032 1 0 GAD
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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