NBPF3 (NBPF member 3)

symbol:
NBPF3
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.12
gene_family:
Neuroblastoma breakpoint family
alias symbol:
AE2
alias name:
None
entrez id:
84224
ensembl gene id:
ENSG00000142794
ucsc gene id:
uc001ber.5
refseq accession:
NM_032264
hgnc_id:
HGNC:25076
approved reserved:
2005-11-23
1p36.12
基因染色体位置图

NBPF3(Neuroblastoma Breakpoint Family Member 3)属于NBPF基因家族,该家族以其在神经母细胞瘤中的染色体易位断点区域而被发现。NBPF基因家族成员在人类基因组中高度扩增,主要分布在1号染色体上,其共同特点是含有多个DUF1220蛋白结构域,这种结构域与大脑发育和认知功能密切相关。NBPF3编码的蛋白质可能参与神经系统的发育和功能调控,研究表明DUF1220结构域的数量与大脑皮层体积及人类认知能力进化相关。NBPF3在多种组织中表达,但在大脑中表达较高,暗示其可能在神经细胞分化或突触可塑性中发挥作用。突变或表达异常可能导致神经发育障碍或神经系统疾病,例如某些研究提示NBPF基因家族与自闭症谱系障碍和精神分裂症等神经精神疾病相关。NBPF3过表达可能影响神经细胞的增殖或迁移,而表达降低则可能导致神经发育异常或认知功能缺陷。由于NBPF基因家族成员间存在高度序列相似性和功能冗余,单个基因如NBPF3的具体功能仍需进一步研究。目前认为NBPF基因家族通过DUF1220结构域参与细胞周期调控、神经元分化和大脑进化,其拷贝数变异与多种神经发育疾病的风险相关。NBPF3作为该家族成员之一,其详细机制仍需更多实验验证,但现有证据支持其在人类大脑发育和疾病中的重要潜在作用。

This gene is a member of the neuroblastoma breakpoint family (NBPF) which consists of dozens of recently duplicated genes primarily located in segmental duplications on human chromosome 1. This gene family has experienced its greatest expansion within the human lineage and has expanded, to a lesser extent, among primates in general. Members of this gene family are characterized by tandemly repeated copies of DUF1220 protein domains. DUF1220 copy number variations in human chromosomal region 1q21.1, where most DUF1220 domains are located, have been implicated in a number of developmental and neurogenetic diseases such as microcephaly, macrocephaly, autism, schizophrenia, mental retardation, congenital heart disease, neuroblastoma, and congenital kidney and urinary tract anomalies. Altered expression of some gene family members is associated with several types of cancer. This gene family contains numerous pseudogenes. [provided by RefSeq, Feb 2013]

此基因是神经母细胞瘤的断点家族(NBPF)由数十个主要位于人染色体1该基因家族在片段重复最近重复基因中的一员经历了人类谱系内其最大的膨胀和扩大,在较小程度上,在一般灵长类动物中。此基因家族成员由DUF1220蛋白质结构域的串联重复拷贝特征。在人类染色体区域1q21.1,大多数DUF1220结构域的位置,DUF1220拷贝数变异已牵涉许多发育和神经源性疾病如小头畸形,大头畸形,孤独症,精神分裂症,精神发育迟缓,先天性心脏疾病,神经母细胞瘤,以及先天肾气和尿道异常。一些基因家族成员的改变的表达与几种类型的癌症相关联。该基因家族包含了许多假。 [由RefSeq的,2013年2月提供]

NBPF3基因的碱基序列:[NCBI]
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NBPF3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs369622       rs374454       rs1001260       rs1001261       rs1051563       rs1051575       rs1566523       rs1759166       rs1814736       rs1814737       rs1827293       rs1966022       rs1971327       rs1971328       rs1976403       rs2004380       rs2010202      

NBPF3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTGTAGCCATCACTGAATCAC
59
GCAATGGAGTGAGATCCGA
60
CCCTGATGTAGAAACTTCCC
58
TCTACAAGGGCTTTATGTGG
57
GATGCTGTATGCATTATCCCAG
59
CCAGATGATCTGGGAGACAC
60
GAGATCCAACAGACTATGAAGAC
59
AGCTTCTCTTCTGTGAGCA
59
GATGCTGTATGCATTATCCCAG
59
CTGCAGATTCCTGGGAGAC
60
CTCAACTCAGACCGTTACCT
59
CTGAGCTCAGAGCTGAAGG
60
GCCCTGATGTAGAAACTTCC
58
ATCACATTTCTGTTGGATCTCG
59
CGAGATCCAACAGTCCCTG
60
TTCATCTCTGCCTTCTCACC
60
GCCCTGATGTAGAAACTTCC
58
TGTCCTCCAATGACACCTC
59
AGTCTGAAGAGGAGGAAGC
58
CACCAATGTCATGTCAGGAG
59
      尚未收录相关数据

NBPF3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NBPF3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
Q9H094 (UniProtKB)
IEA
GO:1903955
Q9H094 (UniProtKB)
IMP

可能调控 NBPF3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alkaline Phosphatase Adverse Event 0.004734064 2 2 GAD
Liver diseases 0.000271442 1 0 BeFree

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