NBPF18P (NBPF member 18, pseudogene)

symbol:
NBPF18P
locus group:
pseudogene
location:
1q21.3
gene_family:
Neuroblastoma breakpoint family
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
441908
ensembl gene id:
ENSG00000240667
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_103561
hgnc_id:
HGNC:31998
approved reserved:
2005-11-23
1q21.3
基因染色体位置图

NBPF18P属于NBPF(Neuroblastoma Breakpoint Family)基因家族,这是一个在人类基因组中高度扩增的基因家族,主要与神经发育和癌症相关。NBPF基因家族的共性在于它们含有多个DUF1220蛋白结构域,这些结构域在灵长类动物中经历了显著的拷贝数扩增,可能与人类大脑的进化和认知功能的增强有关。NBPF18P是一个假基因,这意味着它虽然与功能性NBPF基因相似,但由于突变(如移码突变或提前终止密码子)而失去了编码蛋白质的能力。假基因通常不表达或表达无功能的产物,但某些情况下可能通过调控其他基因的表达来发挥作用。NBPF18P的突变或缺失通常不会对机体产生显著影响,因为假基因本身不编码功能性蛋白。然而,NBPF家族的其他成员(如NBPF1或NBPF10)的异常表达或突变与多种疾病相关,包括神经母细胞瘤、自闭症谱系障碍和精神分裂症。NBPF基因的过表达在某些情况下可能促进细胞增殖或神经发育异常,而降低表达则可能与认知功能障碍或神经退行性疾病有关。由于NBPF18P是假基因,其过表达或降低表达对机体的直接影响尚不明确,但它可能通过竞争性结合调控元件或转录因子间接影响其他NBPF家族成员的功能。研究NBPF基因家族有助于理解人类大脑进化、神经发育疾病和癌症的分子机制。

This pseudogene is a member of the neuroblastoma breakpoint family (NBPF) which consists of dozens of recently duplicated genes primarily located in segmental duplications on human chromosome 1. This gene family has experienced its greatest expansion within the human lineage and has expanded, to a lesser extent, among primates in general. Members of this gene family are characterized by tandemly repeated copies of DUF1220 protein domains. Gene copy number variations in the human chromosomal region 1q21.1, where most DUF1220 domains are located, have been implicated in a number of developmental and neurogenetic diseases such as microcephaly, macrocephaly, autism, schizophrenia, mental retardation, congenital heart disease, neuroblastoma, and congenital kidney and urinary tract anomalies. Altered expression of some gene family members is associated with several types of cancer. This gene family contains numerous pseudogenes. [provided by RefSeq, Jun 2013]

这假是神经母细胞瘤断点家族(NBPF)所组成的几十个主要位于片段重复人类1号染色体上最近重复基因中的一员。此基因家族经历其最大扩张人类谱系内并扩大,在较小程度上,在一般灵长类动物中。此基因家族成员由DUF1220蛋白质结构域的串联重复拷贝特征。在人类染色体区域1q21.1,大多数DUF1220结构域位于基因拷贝数量的变化,已牵涉许多发育和神经源性疾病如小头畸形,大头畸形,孤独症,精神分裂症,精神发育迟缓,先天性心脏疾病,神经母细胞瘤的,和先天肾气和尿道异常。一些基因家族成员的改变的表达与几种类型的癌症相关联。该基因家族包含了许多假。 [由RefSeq的,2013年6月提供]

NBPF18P基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
NBPF18P基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1826173       rs1967084       rs1967085       rs1967086       rs1979637       rs1979638       rs2932566       rs2999548       rs3007715       rs6587644       rs6677973       rs34050111       rs41266048       rs59800570       rs71485831       rs72696912       rs74126777      

NBPF18P基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

NBPF18P基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NBPF18P基因的本体(GO)信息:

可能调控 NBPF18P基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。