MSLN (mesothelin)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
MSLN
locus group:
protein-coding gene
location:
16p13.3
gene_family:
alias symbol:
CAK1|MPF
alias name:
None
entrez id:
10232
ensembl gene id:
ENSG00000102854
ucsc gene id:
uc002cjt.2
refseq accession:
NM_001177355
hgnc_id:
HGNC:7371
approved reserved:
1999-11-22

基因染色体位置

基因染色体位置

16p13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

MSLN（间皮素）是一种由MSLN基因编码的糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定蛋白，主要表达于间皮细胞表面，在正常生理状态下表达水平较低，但在多种恶性肿瘤（如间皮瘤、卵巢癌、胰腺癌等）中显著过表达。MSLN通过与CA125（MUC16）结合参与细胞间粘附、信号转导及肿瘤微环境调控，促进肿瘤细胞增殖、迁移和转移，其过表达与患者预后不良相关。MSLN基因突变较为罕见，但异常表达（如启动子区甲基化改变或转录调控异常）可导致其功能失调，进而促进肿瘤进展。MSLN属于间皮素基因家族，该家族成员均具有GPI锚定结构域，参与细胞膜定位及跨膜信号传导。降低MSLN表达可通过抑制肿瘤生长、增强化疗敏感性改善预后，因此成为靶向治疗的热点（如抗体药物偶联物、CAR-T疗法）。目前针对MSLN的检测已用于辅助诊断间皮瘤，其过表达还可通过激活MAPK/ERK等通路影响下游基因（如MMP、VEGF）的表达，促进血管生成和侵袭。

This gene encodes a precursor protein that is cleaved into two products, megakaryocyte potentiating factor and mesothelin. Megakaryocyte potentiation factor functions as a cytokine that can stimulate colony formation in bone marrow megakaryocytes. Mesothelian is a glycosylphosphatidylinositol-anchored cell-surface protein that may function as a cell adhesion protein. This protein is overexpressed in epithelial mesotheliomas, ovarian cancers and in specific squamous cell carcinomas. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Apr 2010]

这个基因编码被裂解成两个产品，巨核细胞增效因子和间皮素前体蛋白。巨核细胞增强因子功能作为能够刺激骨髓中的巨核细胞集落形成的细胞因子。 Mesothelian是糖基 - 锚定的细胞表面蛋白，其可以作为细胞粘附蛋白起作用。这种蛋白是在上皮间皮瘤，卵巢癌和在特定鳞状细胞癌中过表达。选择性剪接结果在多个抄本变形。[由RefSeq的，2010年4月提供]

OMIM数据库中对MSLN基因的介绍     Wikipedia数据库中对MSLN基因的介绍

基因序列

基因序列

MSLN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

MSLN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1057147       rs1135210       rs2272905       rs2384926       rs57272256       rs58596209       rs58800379       rs61222079       rs74953641       rs111498420       rs112868861       rs113073118       rs115851206       rs138125190       rs138450065       rs139663271       rs140194589      

基因表达

基因表达

MSLN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAACATTTCCAGCCTCTCCC
60
CATTCTTCTGTGCCAAGGC
60
TAACATTTCCAGCCTCTCCC
60
CATTCTTCTGTGCCAAGGC
60
CATAAACTGGATGAGCTCTACC
59
GCTCATCTTGAGGAAGAGGT
59
AACATTTCCAGCCTCTCCC
60
GACATTCTTCTGTGCCAAGG
59
ATAAACTGGATGAGCTCTACC
57
GGCTCATCTTGAGGAAGAG
57
TAACATTTCCAGCCTCTCCC
60
CATTCTTCTGTGCCAAGGC
60
GAAATGAGTCCTCAGGCTC
58
GTGTCTTTGTCTAGCTGGC
59
GAAATGAGTCCTCAGGCTC
58
GTGTCTTTGTCTAGCTGGC
59
AACATTTCCAGCCTCTCCC
60
GACATTCTTCTGTGCCAAGG
59
CATAAACTGGATGAGCTCTACC
59
GCTCATCTTGAGGAAGAGGT
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NAB1
MSLN
Unknown
23025254
RFX1
MSLN
Unknown
23025254
TEAD1
MSLN
Activation
17909009
ZNF24
MSLN
Unknown
23025254

基因本体信息

MSLN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MSLN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q13421 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
Q13421 (UniProtKB)
IEA
GO:0005794
Q13421 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q13421 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q13421 (UniProtKB)
NAS
GO:0007160
Q13421 (UniProtKB)
IBA
GO:0009986
Q13421 (UniProtKB)
IBA
GO:0016020
Q13421 (UniProtKB)
NAS
GO:0031016
Q13421 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
Q13421 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 MSLN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mesothelioma 0.227495081 31 0 BeFree_CTD_human_LHGDN_RGD
Adenocarcinoma 0.126263026 5 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
ovarian neoplasm 0.125991584 5 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Pancreatic Neoplasm 0.125991584 5 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Carcinoma, Pancreatic Ductal 0.12272435 4 0 CTD_human_LHGDN
Cholangiocarcinoma 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Mesothelial Neoplasms 0.12 2 0 CTD_human
Carcinoma, Endometrioid 0.12 1 0 CTD_human
Lymphatic Metastasis 0.12 1 0 CTD_human
Stomach Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

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