LYPD6B (LY6/PLAUR domain containing 6B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LYPD6B
locus group:
protein-coding gene
location:
2q23.2
gene_family:
alias symbol:
CT116|LYPD7
alias name:
cancer/testis antigen 116
entrez id:
130576
ensembl gene id:
ENSG00000150556
ucsc gene id:
uc002twv.2
refseq accession:
NM_177964
hgnc_id:
HGNC:27018
approved reserved:
2008-07-25

基因染色体位置

基因染色体位置

2q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LYPD6B（LY6/PLAUR Domain Containing 6B）属于LY6/PLAUR基因家族，该家族成员通常编码含有LY6/uPAR结构域的蛋白质，这类蛋白质在细胞膜上通过糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定，参与细胞间信号传导、免疫调节和细胞黏附等过程。LYPD6B基因编码的蛋白质可能在神经系统中发挥重要作用，特别是在突触形成和神经元通讯中。研究表明，LYPD6B可能通过与烟碱型乙酰胆碱受体（nAChRs）相互作用，调节受体的功能和稳定性，从而影响神经信号传递。LYPD6B的突变可能导致其与nAChRs的结合能力改变，进而影响神经元的兴奋性和突触可塑性，可能与某些神经系统疾病如精神分裂症或自闭症谱系障碍有关。如果LYPD6B过表达，可能会增强nAChRs的稳定性或功能，导致神经元过度兴奋，可能引发癫痫或其他神经兴奋性相关疾病；而降低表达则可能导致nAChRs功能不足，影响正常的神经信号传递，可能与认知功能障碍或神经退行性疾病相关。LYPD6B在癌症中的研究较少，但有研究表明LY6家族其他成员在某些肿瘤中异常表达，可能与肿瘤发生发展相关，LYPD6B是否具有类似功能尚需进一步研究。LY6/PLAUR基因家族的共性包括编码含有保守LY6/uPAR结构域的蛋白质，这些蛋白质通常参与细胞表面信号传导、免疫应答和细胞黏附等过程，并在多种生理和病理过程中发挥重要作用。

None

无

OMIM数据库中对LYPD6B基因的介绍     Wikipedia数据库中对LYPD6B基因的介绍

基因序列

基因序列

LYPD6B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LYPD6B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs756443       rs881495       rs2713020       rs4667347       rs4667348       rs6433344       rs6751737       rs7608272       rs10177769       rs10183565       rs10192886       rs10196655       rs10930572       rs10930646       rs11353542       rs11682355       rs11684511      

基因表达

基因表达

LYPD6B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAACATACGGAGTGTAGGTC
59
AACACTGCATTAGTGTGATTGG
60
TGAACATACGGAGTGTAGGTC
59
AACACTGCATTAGTGTGATTGG
60
CAGATCGTTATCTTCTCAGAAAGC
60
TTTACTTGTGGTCGAGAGGAG
60
ACAGAGGAAACCAGCTAGC
59
AAGGTAAGTAATGACAAGCAGG
59
CATGGATGTTGTTCCTTAAGGT
59
TCTTCAGTGAACAGAACCAC
58
GATTACTCTGAGTGCAAACCT
58
CCGAACTCTTATATCTTGAGAAGG
59
CTGATTACTCTGAGTGCAAACC
59
GTAAGCACCACACCTTGAG
59
CAATAACTGCCTATCCAGATATGC
59
TGTGATTAACAAGAGCAGCC
58
TGATTACTCTGAGTGCAAACCT
60
GCCTTTCACATCTTGAGAAGG
59
CATGGATGTTATGTGAAAGGCA
59
CGCAGGGAATCTTACTTTCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LYPD6B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LYPD6B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q8NI32 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
Q8NI32 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LYPD6B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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