LUCAT1 (lung cancer associated transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LUCAT1
locus group:
non-coding RNA
location:
5q14.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
SCAL1|SCAT5
alias name:
smoke and cancer associated lncRNA…
entrez id:
100505994
ensembl gene id:
ENSG00000248323
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_103548
hgnc_id:
HGNC:48498
approved reserved:
2013-05-18

基因染色体位置

基因染色体位置

5q14.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LUCAT1（Lung Cancer Associated Transcript 1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），最初在肺癌中被发现，但后续研究表明它在多种癌症和其他疾病中发挥重要作用。LUCAT1通过调控基因表达、表观遗传修饰和信号通路参与细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等生物学过程。其主要作用位点包括细胞核和细胞质，通过与蛋白质、miRNA或其他RNA分子相互作用来影响下游靶基因的表达。LUCAT1的突变或异常表达可能导致其功能失调，进而促进肿瘤发生发展或影响其他疾病进程。例如，在肺癌、结直肠癌、乳腺癌和肝癌中，LUCAT1通常过表达，并与肿瘤的恶性程度、转移和不良预后相关。LUCAT1通过调控如p53、NF-κB和Wnt/β-catenin等关键信号通路来影响肿瘤细胞的生物学行为。此外，LUCAT1还参与炎症反应和免疫调节，可能与自身免疫性疾病有关。当LUCAT1过表达时，通常会促进肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭，并抑制凋亡，从而加速肿瘤进展；而降低LUCAT1表达则可能抑制这些恶性表型，甚至增强化疗或放疗的敏感性。LUCAT1属于lncRNA家族，这一家族的成员通常不编码蛋白质，但通过多种机制调控基因表达，包括染色质重塑、转录干扰、miRNA海绵作用等。lncRNA家族的共性是其高度组织特异性和功能多样性，它们在发育、分化和疾病中扮演关键角色。LUCAT1作为其中的一员，其功能和研究价值正在被逐步揭示，未来可能成为癌症诊断和治疗的潜在靶点。

None

无

OMIM数据库中对LUCAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对LUCAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

LUCAT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LUCAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1912726       rs4639266       rs4916857       rs4916858       rs5869540       rs6865066       rs6876796       rs6877420       rs6882178       rs7704529       rs7721772       rs7727632       rs7732832       rs9293563       rs9293564       rs9293565       rs10036206      

基因表达

基因表达

LUCAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAACCCATCAGAAGATGTCAG
58
TGCCTCTGTTTATCCATCTC
57
ACAATGGTATTTCTGACTTGGC
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60
ACAATGGTATTTCTGACTTGGC
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60
CAATGGTATTTCTGACTTGGC
58
GAGCGAAACTCTGTAGCTC
58
AACCCATCAGAAGATGTCAG
57
TGCCTCTGTTTATCCATCTC
57
CAATGGTATTTCTGACTTGGC
58
GAGCGAAACTCTGTAGCTC
58
CAATGGTATTTCTGACTTGGCT
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60
CATCAGAAGATGTCAGAAGATAAGG
59
GTTGCCTCTGTTTATCCATCTC
59
CAATGGTATTTCTGACTTGGCT
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LUCAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LUCAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LUCAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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