LINC01567 (long intergenic non-protein coding RNA 1567)

symbol:
LINC01567
locus group:
non-coding RNA
location:
16p12.1
gene_family:
alias symbol:
LOCCS
alias name:
lncRNA overexpressed in colon canc…
entrez id:
400511
ensembl gene id:
ENSG00000224310
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_122072
hgnc_id:
HGNC:51367
approved reserved:
2014-10-16
16p12.1
基因染色体位置图

LINC01567是一种长链非编码RNA(lncRNA)基因,属于长链非编码RNA基因家族。这类基因通常不编码蛋白质,但通过调控其他基因的表达在多种生物学过程中发挥重要作用。LINC01567的具体功能尚未完全明确,但研究表明它可能在细胞增殖、分化和肿瘤发生中起作用。该基因的表达产物通过表观遗传调控、转录后修饰或作为竞争性内源RNA(ceRNA)影响信号通路。主要作用位点可能涉及与特定microRNA或蛋白质的相互作用,从而间接调控下游靶基因的表达。目前关于LINC01567突变的研究较少,但lncRNA的突变或表达异常通常会导致其调控网络紊乱,可能影响细胞稳态并与疾病相关。有研究发现LINC01567在多种癌症中异常表达,例如在结直肠癌中可能作为癌基因促进肿瘤进展,而在某些其他癌症中可能起抑癌作用,这表明其功能具有组织特异性。当LINC01567过表达时,可能通过激活促癌信号通路(如Wnt/β-catenin)或抑制抑癌基因导致细胞恶性转化;而表达降低则可能影响正常的细胞分化或凋亡过程。该基因属于LINC(long intergenic non-coding RNA)家族,这一家族的成员通常位于蛋白质编码基因之间,长度超过200个核苷酸,具有组织特异性表达模式,并在发育、代谢和疾病中起调控作用。LINC01567的研究仍处于早期阶段,深入了解其分子机制可能为相关疾病的诊断和治疗提供新靶点。

None

LINC01567基因的碱基序列:[NCBI]
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LINC01567基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2040603       rs4488448       rs7498578       rs8045064       rs8053115       rs8057291       rs8058135       rs9674274       rs10635620       rs10661967       rs10713787       rs11074644       rs11859165       rs12103149       rs12597894       rs12919283       rs12919816      

LINC01567基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACAGAAAGGGTTATCTCAAGAGG
60
TGCAGGAACAGGTGAAGAG
60
TGTCAGCATCATATCAGCCT
59
CACAGAATCACGGGATGGT
60
TCAGCATCATATCAGCCTCTC
60
CACAGAATCACGGGATGGT
60
      尚未收录相关数据

LINC01567基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC01567基因的本体(GO)信息:

可能调控 LINC01567基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alzheimer's Disease 0.12 1 1 GWASCAT

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