LINC01194 (long intergenic non-protein coding RNA 1194)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC01194
locus group:
non-coding RNA
location:
5p15.2
gene_family:
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TAG
alias name:
tumor antigen gene
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404663
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None
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NR_033383
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HGNC:37171
approved reserved:
2012-11-30

基因染色体位置

基因染色体位置

5p15.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC01194是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于长链非编码RNA基因家族。这类基因通常不编码蛋白质，但通过调控其他基因的表达在多种生物学过程中发挥重要作用。LINC01194的具体功能尚未完全阐明，但研究表明它可能参与细胞增殖、分化和凋亡等过程，并在某些癌症中异常表达。LINC01194的作用位点可能涉及染色质重塑、转录调控或作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而间接调控靶基因的表达。突变或表达异常可能影响其调控功能，导致疾病发生。例如，在某些肿瘤中，LINC01194的表达水平与患者预后相关，提示其可能作为癌症的生物标志物或治疗靶点。LINC01194过表达可能促进肿瘤细胞增殖和转移，而降低表达可能抑制这些恶性表型。长链非编码RNA基因家族的共性包括调控基因表达、参与表观遗传修饰和信号通路调控，并在发育、免疫和疾病中发挥多样化作用。尽管LINC01194的具体机制仍需进一步研究，但其在疾病中的潜在作用使其成为科学关注的焦点。

None

无

OMIM数据库中对LINC01194基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC01194基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC01194基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC01194基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3925040       rs4129872       rs4133113       rs4133333       rs4247241       rs4263493       rs4277918       rs4280865       rs4295393       rs4296805       rs4327597       rs4330463       rs4340920       rs4352596       rs4354041       rs4354042       rs4358519      

基因表达

基因表达

LINC01194基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGGGTAAATATGTGCCATGG
59
CTGCCATTCTTATTTCCGGG
59
ATAGACTGCTCTTGAGGCTG
59
GGAGGATCTCTTGAGACTAGG
59
CAGCAATAGACTGCTCTTGAG
59
AAATAGCCATCCCAGGGAG
59
ACATGGGTAAATATGTGCCA
57
CATAACTCTTGTATCGGGCT
57
TAGACTGCTCTTGAGGCTG
59
GGAGGATCTCTTGAGACTAGG
59
CATGGGTAAATATGTGCCATGG
60
CCATAACTCTTGTATCGGGCT
60
TGTTGTTATCATAGCTCACTGC
59
AAATAGCCATCCCAGGGAG
59
TGGGTAAATATGTGCCATGG
58
TCTGCCATTCTTATTTCCGG
58
TGGGTAAATATGTGCCATGG
58
TTCCATAACTCTTGTATCGGG
57
GTTGTTATCATAGCTCACTGCA
59
AAATAGCCATCCCAGGGAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC01194基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC01194基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC01194基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.011672 43 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.003528744 13 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.003257302 12 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.003257302 12 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Aortic Aneurysm, Thoracic 0.002442977 9 0 BeFree
Liver carcinoma 0.002171535 8 0 BeFree
Hepatitis B 0.002171535 8 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.002171535 8 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.001900093 7 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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