LINC01133 (long intergenic non-protein coding RNA 1133)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC01133
locus group:
non-coding RNA
location:
1q23.2
gene_family:
alias symbol:
lncRNA-PAGBC
alias name:
prognosis-associated gallbladder c…
entrez id:
100505633
ensembl gene id:
ENSG00000224259
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_038849
hgnc_id:
HGNC:49447
approved reserved:
2013-12-03

基因染色体位置

基因染色体位置

1q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC01133是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于长链非编码RNA基因家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但能通过调控基因表达参与多种生物学过程。LINC01133在多种癌症中表现出异常表达，尤其在结直肠癌、胃癌和肺癌中常出现过表达，其高表达与肿瘤进展、转移和不良预后密切相关。LINC01133通过多种机制发挥作用，例如作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，促进肿瘤相关信号通路（如Wnt/β-catenin和PI3K/AKT）的激活。此外，LINC01133还能与蛋白质相互作用，影响细胞周期、凋亡和上皮-间质转化（EMT）等过程。若LINC01133表达降低，可能抑制肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移，而过度表达则会加速这些恶性行为。研究发现，LINC01133的突变或表达异常可能与癌症耐药性相关，例如在结直肠癌中，其高表达可能导致5-氟尿嘧啶化疗敏感性下降。尽管LINC01133属于lncRNA家族，其具体功能具有高度组织特异性，不同癌症中可能通过不同靶点发挥作用。目前针对LINC01133的研究主要集中在癌症领域，尚未发现其在正常生理功能中的明确作用。由于lncRNA通常具有保守性低的特点，LINC01133的调控机制可能涉及表观遗传修饰（如DNA甲基化）或转录因子结合。未来研究可能进一步揭示其分子机制及作为癌症诊断标志物或治疗靶点的潜力。

None

None

OMIM数据库中对LINC01133基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC01133基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC01133基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC01133基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1934073       rs2789424       rs2820564       rs2820565       rs2840587       rs2840588       rs2840589       rs2840590       rs2840591       rs4378200       rs4406627       rs4656249       rs4656860       rs6143441       rs6427500       rs6660863       rs7521490      

基因表达

基因表达

LINC01133基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCATTAACAACGAGGCTCC
59
CCTATTCAAGTTCTGTCTGGG
58
AGGAGCCATTAACAAAGCT
57
AGAATCTTCAGTTGCAGGG
57
CATTAACAACGAGGCTCCT
58
CCTATTCAAGTTCTGTCTGGG
58
GAGGAGCCATTAACAAAGCT
58
GAATCTTCAGTTGCAGGGA
58
TAGCTTCCCTTTGGATCTGG
59
GGAGCCTCGTTGTTAATGG
59
AGGAGCCATTAACAAAGCT
57
GAATCTTCAGTTGCAGGGA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC01133基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC01133基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC01133基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant Squamous Cell Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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