LINC00920 (long intergenic non-protein coding RNA 920)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC00920
locus group:
non-coding RNA
location:
16q21
gene_family:
alias symbol:
CALIC|LINRIS
alias name:
cancer metastasis‐associated lon…
entrez id:
100505865
ensembl gene id:
ENSG00000246898
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_046242
hgnc_id:
HGNC:48611
approved reserved:
2013-05-24

基因染色体位置

基因染色体位置

16q21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC00920是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于长链非编码RNA基因家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但能通过调控基因表达、染色质修饰或信号通路参与多种生物学过程。LINC00920的具体功能尚未完全明确，但研究表明它可能在细胞增殖、分化和肿瘤发生中发挥作用。该基因的表达产物通过与其他RNA或蛋白质相互作用，影响下游基因的转录或翻译，进而调控细胞功能。其主要作用位点可能涉及细胞核或细胞质，参与表观遗传调控或信号转导。突变或异常表达可能破坏其调控网络，导致疾病发生，例如某些癌症中LINC00920的表达水平异常升高或降低，与肿瘤进展或转移相关。过表达LINC00920可能促进细胞增殖或抑制凋亡，而降低表达则可能抑制肿瘤生长或恢复正常的细胞周期调控。此外，LINC00920可能与其他基因（如癌基因或抑癌基因）相互作用，形成复杂的调控网络。长链非编码RNA家族的共性包括调控基因表达、参与染色质重塑、影响mRNA稳定性或翻译效率等。尽管LINC00920的具体机制仍需进一步研究，但其在疾病中的潜在作用使其成为生物标志物或治疗靶点的候选分子。

None

无

OMIM数据库中对LINC00920基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC00920基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC00920基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC00920基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2289149       rs2289150       rs8050148       rs9788905       rs11642714       rs11648027       rs11863488       rs11863521       rs16956512       rs34481671       rs35687199       rs35732539       rs55833121       rs57119773       rs57798175       rs71392148       rs72786460      

基因表达

基因表达

LINC00920基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAAGCTAAACATGGATCCC
58
TCCTTCTCTAGTCAAGGCT
57
CTGAAGCTAAACATGGATCCC
59
CTTCTCTAGTCAAGGCTTGAG
58
TGAAGCTAAACATGGATCCC
58
CTTCTCTAGTCAAGGCTTGAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC00920基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC00920基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC00920基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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