LINC00858 (long intergenic non-protein coding RNA 858)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC00858
locus group:
non-coding RNA
location:
10q23.1
gene_family:
alias symbol:
CRCAL-2
alias name:
colorectal cancer associated lncRNA
entrez id:
170425
ensembl gene id:
ENSG00000229404
ucsc gene id:
uc001kdf.1
refseq accession:
NR_038220
hgnc_id:
HGNC:27276
approved reserved:
2013-02-15

基因染色体位置

基因染色体位置

10q23.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC00858是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于长链非编码RNA基因家族。长链非编码RNA是一类长度超过200个核苷酸但不编码蛋白质的RNA分子，它们通过调控基因表达、染色质修饰、信号传导等多种机制参与细胞生命活动。LINC00858的具体生物学功能尚未完全阐明，但研究表明它可能在细胞增殖、分化和肿瘤发生发展中发挥作用。LINC00858的表达产物不编码蛋白质，而是以RNA形式发挥作用，可能通过与其他RNA、蛋白质或DNA相互作用来调控靶基因的表达。主要作用位点可能涉及细胞核或细胞质，具体机制仍需进一步研究。突变对LINC00858功能的影响目前研究较少，但lncRNA的突变或表达异常通常会影响其与结合伙伴的相互作用，进而干扰相关信号通路。LINC00858与某些疾病的关系已有初步探索，例如在多种癌症中（如胃癌、结直肠癌、乳腺癌等）发现其表达异常，可能作为肿瘤标志物或治疗靶点。当LINC00858过表达时，可能促进肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭，抑制其凋亡；而降低表达时可能抑制肿瘤进展，但具体效应因癌症类型和微环境而异。LINC00858还可能通过竞争性内源RNA（ceRNA）机制调控其他基因的表达，例如吸附微小RNA（miRNA）从而解除miRNA对靶mRNA的抑制作用。长链非编码RNA基因家族的共性包括：不编码蛋白质、具有组织或发育阶段特异性表达模式、通过多种机制调控基因表达、参与重要的生理和病理过程。由于lncRNA的功能高度依赖于其二级结构和序列特异性，不同lncRNA的功能差异较大。LINC00858的研究仍处于早期阶段，深入探索其分子机制和临床意义将有助于理解其在疾病中的作用并为治疗提供新思路。

None

无

OMIM数据库中对LINC00858基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC00858基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC00858基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC00858基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs4281435       rs4366428       rs4933318       rs4933997       rs7068652       rs7085624       rs7894492       rs7895411       rs7897738       rs7897842       rs7898126       rs7898509       rs7899852       rs7903999       rs7914940       rs7922596       rs10749484      

基因表达

基因表达

LINC00858基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAATAGGAACAGCTCCGGT
59
CCAAGCCTAACTCAGATGGA
59
TTCCATCTGAGTTAGGCTTGG
60
TGACAAGGTGACTGAGCTG
60
CCTACTAACAAAGCACTGGT
58
TCTGGACTTCTGTAGTAGTCAG
59
AATAGGAACAGCTCCGGTC
59
CCAAGCCTAACTCAGATGGA
59
TCCATCTGAGTTAGGCTTGG
59
TGACAAGGTGACTGAGCTG
60
CCTGACTACTACAGAAGTCCAG
59
AACCATTTGTGATGGAATCACC
60
CCCTGACTACTACAGAAGTCC
59
ACCATTTGTGATGGAATCACC
59
GAACAGCTCCGGTCTACAG
60
CCAAGCCTAACTCAGATGGA
59
GAACAGCTCCGGTCTACAG
59
CCAAGCCTAACTCAGATGGA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC00858基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC00858基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC00858基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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